RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A PIN4P34217 668 aaKnown RBP RIP-Chip data4.46□□□□□ -1.7not detected
YMR001C-AYMR001C-A YLL058WQ12198 575 aa4.46□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A NPC2Q12408 173 aa4.46□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A HSF1P10961 833 aa4.45□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A CCC2P38995 1004 aa4.45□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A IOC3P43596 787 aa4.45□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A NCS6P53088 359 aa4.45□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A AIM39Q08223 395 aa4.45□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A RAD53P22216 821 aa4.44□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A PSP2P50109 593 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A FAL1Q12099 399 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A KAR4P25583 335 aa4.43□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A CDC12P32468 407 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A DUS3Q06053 668 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A CAD1P24813 409 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A URM1P40554 99 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A CWC24P53769 259 aa4.42□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A URN1Q06525 465 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A YPR196WQ06595 470 aa4.42□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A RPP2AP05319 106 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A PRI2P20457 528 aa4.41□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A YKL069WP36088 180 aa4.41□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A VBA5P36172 582 aa4.41□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A SNF7P39929 240 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A SRP1Q02821 542 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A PPM2Q08282 695 aa4.41□□□□□ -1.7
YMR001C-AYMR001C-A AGP1P25376 633 aa4.4□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A SBA1P28707 216 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A MOH1P38191 138 aa4.4□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A BUL1P48524 976 aa4.4□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A YLR040CQ07988 224 aa4.4□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A UPC2Q12151 913 aa4.4□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A EFT1P32324 842 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A MAD1P40957 749 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A GYP7P48365 746 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A ENB1Q08299 606 aa4.39□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A NPP1P25353 742 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A ATG19P35193 415 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A OAR1P35731 278 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A SUL1P38359 859 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A TSL1P38427 1098 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A YER158CP40095 573 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A VPS16Q03308 798 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A JIP5Q06214 492 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A YDR306CQ06640 478 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A OPI10Q08202 246 aa4.38□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A STE14P32584 239 aa4.37□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data4.37□□□□□ -1.71not detected
YMR001C-AYMR001C-A RAI1P53063 387 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A SLU7Q02775 382 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A YMR206WQ03695 313 aa4.37□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A YOL073CQ08232 322 aa4.37□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A PIN2Q12057 282 aa4.37□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A NOT3P06102 836 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A CLN2P20438 545 aa4.36□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A PPH3P32345 308 aa4.36□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A GUP2Q08929 609 aa4.36□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A TRM13Q12383 476 aa4.36□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A SED4P25365 1065 aa4.35□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A RPC82P32349 654 aa4.35□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A RPD3P32561 433 aa4.35□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A AFR1P33304 620 aa4.35□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A ERT1P38140 529 aa4.35□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A UBA2P52488 636 aa4.35□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A ERG4P25340 473 aa4.34□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A CDC48P25694 835 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A YRO2P38079 344 aa4.34□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A KRI1P42846 591 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A SHE9Q04172 456 aa4.34□□□□□ -1.71
YMR001C-AYMR001C-A AAR2P32357 355 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A YKR078WP36158 585 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A STB4P50104 949 aa4.33□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A YKE2P52553 114 aa4.33□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A TRP4P07285 380 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A KTR4P38131 464 aa4.32□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data4.32□□□□□ -1.72not detected
YMR001C-AYMR001C-A ADE8P04161 214 aa4.31□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A STE5P32917 917 aa4.31□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A STE13P33894 931 aa4.31□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A VAC8P39968 578 aa4.31□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A ERG5P54781 538 aa4.31□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A MUK1Q02866 612 aa4.31□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A TMN2Q04562 672 aa4.31□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A SEC21P32074 935 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A ALG7P07286 448 aa4.29□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A FBP1P09201 348 aa4.29□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A MRP8P35719 219 aa4.29□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A YBR238CP38330 731 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A YIL108WP40483 696 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A ALD6P54115 500 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A RNT1Q02555 471 aa4.29□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A PEX19Q07418 342 aa4.29□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A MCH5Q08777 521 aa4.29□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A PBY1P38254 753 aa4.28□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A CEP3P40969 608 aa4.28□□□□□ -1.72
YMR001C-AYMR001C-A RFA1P22336 621 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A HBS1P32769 611 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A YBR184WP38299 523 aa4.27□□□□□ -1.73
YMR001C-AYMR001C-A SPF1P39986 1215 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.4 ms