RNA–Protein interactions for RNA: YLL047W

YLL047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLL047W, Length 384 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL047WYLL047W CDC48P25694 835 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
YLL047WYLL047W AFR1P33304 620 aa6.28□□□□□ -1.4
YLL047WYLL047W THI80P35202 319 aa6.28□□□□□ -1.4
YLL047WYLL047W UBP5P39944 805 aa6.28□□□□□ -1.4
YLL047WYLL047W CDC6P09119 513 aa6.27□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W HSF1P10961 833 aa6.27□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W ATG19P35193 415 aa6.27□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W CCC2P38995 1004 aa6.27□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W NPP2P39997 493 aa6.27□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W ZRG8P40021 1076 aa6.27□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W IOC3P43596 787 aa6.27□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W YGR012WP53206 393 aa6.27□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W VPS62P53285 467 aa6.27□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data6.27□□□□□ -1.41not detected
YLL047WYLL047W PLB2Q03674 706 aa6.27□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W CDA1Q06702 301 aa6.27□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W RXT3Q07458 294 aa6.27□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W ADY3Q07732 790 aa6.27□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W FLC1Q08967 793 aa6.27□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data6.26□□□□□ -1.41not detected
YLL047WYLL047W ARE1P25628 610 aa6.26□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W HUL4P40985 892 aa6.26□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W PSP2P50109 593 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W HUL5P53119 910 aa6.26□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W YGR125WP53273 1036 aa6.26□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W TAF8Q03750 510 aa6.26□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W GPB1Q08886 897 aa6.26□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W HMI1Q12039 706 aa6.26□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W GAL11P19659 1081 aa6.25□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W NPP1P25353 742 aa6.25□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W PET10P36139 283 aa6.25□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W YRO2P38079 344 aa6.25□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W POA1P38218 177 aa6.25□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W MET12P46151 657 aa6.25□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W RPN4Q03465 531 aa6.25□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W ROT1Q03691 256 aa6.25□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W YDL124WQ07551 312 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W NOP12Q08208 459 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W HBN1Q96VH4 193 aa6.25□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W SPT20P50875 604 aa6.24□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W UBX5Q06682 500 aa6.24□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W TPO1Q07824 586 aa6.24□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W YOR131CQ12486 218 aa6.24□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W YTA7P40340 1379 aa6.23□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W YLR358CO13565 187 aa6.23□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W SPE1P08432 466 aa6.23□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W STE11P23561 717 aa6.23□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W CDC20P26309 610 aa6.23□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W CHZ1P40019 153 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W TOK1P40310 691 aa6.23□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W SFB2P53953 876 aa6.23□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W SRP101P32916 621 aa6.22□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W REC104P33323 182 aa6.22□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W TOD6P34219 525 aa6.22□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W RSP5P39940 809 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W RAI1P53063 387 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W FPR4Q06205 392 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W YPR196WQ06595 470 aa6.22□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W PPM2Q08282 695 aa6.22□□□□□ -1.41
YLL047WYLL047W HIS5P07172 385 aa6.21□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W ENA1P13587 1091 aa6.21□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W MSD1P15179 658 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W URM1P40554 99 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W UBP6P43593 499 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W ENA2Q01896 1091 aa6.21□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W ENA5Q12691 1091 aa6.21□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W CAN1P04817 590 aa6.2□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W EMC1P25574 760 aa6.19□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W FLR1P38124 548 aa6.19□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W CHA4P43634 648 aa6.19□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W VPS30Q02948 557 aa6.19□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W YAP6Q03935 383 aa6.19□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W ESC8Q08119 714 aa6.19□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W YPR071WQ12346 211 aa6.19□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W BUD6P41697 788 aa6.18□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W GTF1P53260 183 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W YLR224WQ05947 369 aa6.18□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W NOT3P06102 836 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W MPH2P0CD99 609 aa6.17□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W STE13P33894 931 aa6.17□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W YBR284WP38150 797 aa6.17□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W OSW7P43611 510 aa6.17□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data6.17□□□□□ -1.42not detected
YLL047WYLL047W ENV7Q12003 364 aa6.17□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W TOP3P13099 656 aa6.16□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W EMC3P36039 253 aa6.16□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W BET3P36149 193 aa6.16□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W PBP2P38151 413 aaKnown RBP RIP-Chip data6.16□□□□□ -1.42not detected
YLL047WYLL047W NIT3P49954 291 aa6.16□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W RTA1P53047 317 aa6.16□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W TOM70P07213 617 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W FBP1P09201 348 aa6.15□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W ERT1P38140 529 aa6.15□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W DAM1P53267 343 aa6.15□□□□□ -1.42
YLL047WYLL047W RFA1P22336 621 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.6 ms