RNA–Protein interactions for RNA: YJL057C

IKS1, Transcript of Protein kinase of unknown cellular role, yeast

Gene IKS1, Length 2,004 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IKS1	YJL057C	SIT1	P39980	628 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	PSY2	P40164	858 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	ALF1	P53904	254 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RAD33	Q04231	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	ADY3	Q07732	790 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RMP1	Q12530	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	REC107	P21651	314 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	VHR1	P40522	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	GZF3	P42944	551 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	CIT3	P43635	486 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	ENV11	P53246	860 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	MDM38	Q08179	573 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	GYP1	Q08484	637 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	REX3	Q12090	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TAH18	Q12181	623 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	HTA2	P04912	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	GCD10	P41814	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	BNI4	P53858	892 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	ZDS2	P54786	942 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SSL2	Q00578	843 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	VTC3	Q02725	835 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	BLS1	Q06071	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	YLH47	Q06493	454 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	HIM1	Q06674	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SSM4	P40318	1319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	YER152C	P10356	443 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	INO1	P11986	533 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	MSN1	P22148	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	DAL1	P32375	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	CBF2	P32504	956 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	NPL6	P32832	435 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	MDJ1	P35191	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	MTH1	P35198	433 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RIC1	P40395	1056 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TY1A-DR4	O74302	440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RPC40	P07703	335 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TY1A-H	P0C2I4	478 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TY1A-A	P0CX57	440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TY1A-PR1	P0CX58	440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TY1A-OR	P0CX59	440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TY1A-PR2	P0CX60	440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TY1A-DR5	P0CX65	440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TY1A-ER2	P0CX66	440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TY1A-GR3	P0CX67	440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TY1A-LR1	P0CX68	440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TY1A-MR2	P0CX69	440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TRK1	P12685	1235 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SWC3	P31376	625 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TFB1	P32776	642 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	RIB7	P33312	244 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	YEL1	P34225	687 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	BYE1	P36106	594 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	YEL068C	P39977	110 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	IMA5	P40884	581 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	VPS53	P47061	822 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TY1A-JR2	P47099	440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	GUD1	Q07729	489 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	AVO1	Q08236	1176 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TY1A-BR	Q12217	440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		4.9	□□□□□ -1.62
IKS1	YJL057C	STF1	P01098	86 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	SEC2	P17065	759 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	PET123	P17558	318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	RAM1	P22007	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	FUN30	P31380	1131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	MCM7	P38132	845 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	RMD8	P43620	662 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	YGL140C	P53120	1219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	DPL1	Q05567	589 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
IKS1	YJL057C	PDX1	P16451	410 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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