RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeastyeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HCA4YJL033W YLL058WQ12198 575 aa4.83□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W CDC25P04821 1589 aa4.83□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W SCT1P32784 759 aa4.83□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W ETP1P38748 585 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W DNF1P32660 1571 aa4.83□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W KIN2P13186 1147 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W TCB2P48231 1178 aa4.82□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W TPO2P53283 614 aa4.82□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W RAD4P14736 754 aa4.81□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W ABZ1P37254 787 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W SAH1P39954 449 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W GUS1P46655 708 aaKnown RBP RIP-Chip data4.81□□□□□ -1.64not detected
HCA4YJL033W SNO2P53823 222 aa4.81□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data4.81□□□□□ -1.64not detected
HCA4YJL033W DUS3Q06053 668 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W BUD3P25558 1636 aa4.81□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W HRQ1Q05549 1077 aa4.81□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W YDR306CQ06640 478 aa4.81□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W FMP25Q08023 583 aa4.81□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W OSH2Q12451 1283 aa4.81□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W NUP170P38181 1502 aa4.8□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W APL1P27351 700 aa4.8□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W SEG2P34250 1132 aa4.8□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W MNN4P36044 1178 aa4.8□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W YKL151CP36059 337 aa4.8□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W PFD1P46988 109 aa4.8□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W MTC3P53077 123 aa4.8□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W YDL177CQ12257 170 aa4.8□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W SNT2P53127 1403 aa4.8□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W RPL8BP29453 256 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W FUN12P39730 1002 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W AVT1P47082 602 aa4.8□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W ERP6P53198 216 aa4.8□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W MRPL22P53881 309 aa4.8□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W EAF1Q06337 982 aa4.8□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W MDM38Q08179 573 aa4.8□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W YOR352WQ08816 343 aa4.8□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W CDC12P32468 407 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W PRS1P32895 427 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W OCA5P38738 679 aa4.79□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W TIM54P47045 478 aa4.79□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W UTP8P53276 713 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W YOL098CQ12496 1037 aa4.79□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W CYC1P00044 109 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W PPH3P32345 308 aa4.79□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W AAR2P32357 355 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W HFM1P51979 1187 aa4.79□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W PRP43P53131 767 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W OSW2Q12202 724 aa4.79□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W TY1B-ER2Q03619 1755 aa4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W TY1B-MR1Q04214 1755 aa4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W TY1B-NL1Q12112 1755 aa4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W TY1B-GR1Q12141 1755 aa4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W TY1B-BLQ12490 1755 aa4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W ADE8P04161 214 aa4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W STI1P15705 589 aaKnown RBP RIP-Chip data4.78□□□□□ -1.64not detected
HCA4YJL033W CLC1P17891 233 aa4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W NIT1P40447 199 aa4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W ALR2P43553 858 aa4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W SIZ1Q04195 904 aa4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W NSE3Q05541 303 aa4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W HSP60P19882 572 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W CDC11P32458 415 aa4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W IME2P32581 645 aa4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W SIT1P39980 628 aa4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W SRT1Q03175 343 aa4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W MSC2Q03455 724 aa4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W RIB2Q12362 591 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W SEC3P33332 1336 aaKnown RBP4.78□□□□□ -1.64
HCA4YJL033W ARO1P08566 1588 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W GAS1P22146 559 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W ARE1P25628 610 aa4.77□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W ELM1P32801 640 aa4.77□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W HUL5P53119 910 aa4.77□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W YGR125WP53273 1036 aa4.77□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W SGD1Q06132 899 aa4.77□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W BDF2Q07442 638 aa4.77□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W CDC53Q12018 815 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W YBT1P32386 1661 aa4.77□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W CMP2P14747 604 aa4.77□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W FUN30P31380 1131 aa4.77□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W TSA1P34760 196 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W HBS1P32769 611 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W IOC3P43596 787 aa4.76□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W FLC1Q08967 793 aa4.76□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W PDR10P51533 1564 aa4.76□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W YKR078WP36158 585 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W GIC1P38785 314 aa4.75□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W YAP1801P38856 637 aa4.75□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W GYP7P48365 746 aa4.75□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W UBX5Q06682 500 aa4.75□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data4.75□□□□□ -1.65not detected
HCA4YJL033W YOR131CQ12486 218 aa4.75□□□□□ -1.65
HCA4YJL033W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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