RNA–Protein interactions for RNA: YHR156C

LIN1, Transcript of Non-essential component of U5 snRNP, yeast

Gene LIN1, Length 1,023 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LIN1	YHR156C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LIN1	YHR156C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LIN1	YHR156C	MDM38	Q08179	573 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LIN1	YHR156C	KCS1	Q12494	1050 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LIN1	YHR156C	GIC1	P38785	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIN1	YHR156C	MBP1	P39678	833 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIN1	YHR156C	NPP2	P39997	493 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIN1	YHR156C	SHE9	Q04172	456 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIN1	YHR156C	LAS17	Q12446	633 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LIN1	YHR156C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	RAD53	P22216	821 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	SRT1	Q03175	343 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	OSW2	Q12202	724 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	SPE1	P08432	466 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	FUN30	P31380	1131 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	STE5	P32917	917 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	BUL1	P48524	976 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	YGR012W	P53206	393 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	ENA1	P13587	1091 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	MRP8	P35719	219 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	NCS6	P53088	359 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	SRP101	P32916	621 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	YPT53	P36019	220 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	YBR184W	P38299	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	IRR1	P40541	1150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	IOC3	P43596	787 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	PBY1	P38254	753 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LIN1	YHR156C	HSF1	P10961	833 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
LIN1	YHR156C	PFD1	P46988	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	WHI4	Q07655	649 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	ENB1	Q08299	606 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	NPC2	Q12408	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	SFB2	P53953	876 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	FMP25	Q08023	583 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	RAD4	P14736	754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	KAR4	P25583	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	STE14	P32584	239 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	OAR1	P35731	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	YJL049W	P47048	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	NNF1	P47149	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	YDR306C	Q06640	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	PPM2	Q08282	695 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	UPC2	Q12151	913 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	MOH1	P38191	138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	CCC2	P38995	1004 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	GYP7	P48365	746 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	GUP2	Q08929	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	AFR1	P33304	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	AIM39	Q08223	395 aa		4.85	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	NPP1	P25353	742 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	RPC82	P32349	654 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	ATG19	P35193	415 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	OCA5	P38738	679 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	SIT1	P39980	628 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	ALR2	P43553	858 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	YKE2	P52553	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	EAF1	Q06337	982 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	SPO75	Q07798	868 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.84	□□□□□ -1.63
LIN1	YHR156C	PPH3	P32345	308 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LIN1	YHR156C	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LIN1	YHR156C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
LIN1	YHR156C	TIM54	P47045	478 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LIN1	YHR156C	HUL5	P53119	910 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LIN1	YHR156C	ERP6	P53198	216 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LIN1	YHR156C	ERG5	P54781	538 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LIN1	YHR156C	UBX5	Q06682	500 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LIN1	YHR156C	BDF2	Q07442	638 aa		4.83	□□□□□ -1.64
LIN1	YHR156C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
LIN1	YHR156C	NSE3	Q05541	303 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LIN1	YHR156C	OSH2	Q12451	1283 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LIN1	YHR156C	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.82	□□□□□ -1.64
LIN1	YHR156C	ADE8	P04161	214 aa		4.81	□□□□□ -1.64
LIN1	YHR156C	ARE1	P25628	610 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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