RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W YUR1P26725 428 aa9.8□□□□□ -0.84
DDI1YER143W YKL091CP33324 310 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
DDI1YER143W SHM1P37292 490 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
DDI1YER143W RSC30P38781 883 aa9.8□□□□□ -0.84
DDI1YER143W UBP5P39944 805 aa9.8□□□□□ -0.84
DDI1YER143W SEC5P89102 971 aa9.8□□□□□ -0.84
DDI1YER143W CDC37P06101 506 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
DDI1YER143W PHO13P19881 312 aa9.79□□□□□ -0.84
DDI1YER143W TRK2P28584 889 aa9.79□□□□□ -0.84
DDI1YER143W SEC8P32855 1065 aa9.79□□□□□ -0.84
DDI1YER143W STR2P47164 639 aa9.79□□□□□ -0.84
DDI1YER143W NBP1P52919 319 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
DDI1YER143W ZPR1P53303 486 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
DDI1YER143W YAP7Q08182 245 aa9.79□□□□□ -0.84
DDI1YER143W TFC4P33339 1025 aa9.78□□□□□ -0.84
DDI1YER143W TVP38P36164 337 aa9.78□□□□□ -0.84
DDI1YER143W UBP15P50101 1230 aa9.78□□□□□ -0.84
DDI1YER143W SCS3P53012 380 aa9.78□□□□□ -0.84
DDI1YER143W VPS75P53853 264 aa9.78□□□□□ -0.84
DDI1YER143W YLR225CQ05948 407 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
DDI1YER143W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
DDI1YER143W YDR461C-AQ2V2P7 80 aa9.78□□□□□ -0.84
DDI1YER143W RPS6AP0CX37 236 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
DDI1YER143W RPS6BP0CX38 236 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
DDI1YER143W TCP1P12612 559 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
DDI1YER143W OM45P16547 393 aa9.77□□□□□ -0.85
DDI1YER143W DAL7P21826 554 aa9.77□□□□□ -0.85
DDI1YER143W SPO11P23179 398 aa9.77□□□□□ -0.85
DDI1YER143W YEL1P34225 687 aa9.77□□□□□ -0.85
DDI1YER143W MIP6P38760 659 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
DDI1YER143W HMF1P40037 129 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
DDI1YER143W TOS3P43637 560 aa9.77□□□□□ -0.85
DDI1YER143W YPL277CQ08989 487 aa9.77□□□□□ -0.85
DDI1YER143W PDC1P06169 563 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
DDI1YER143W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
DDI1YER143W PCK1P10963 549 aa9.76□□□□□ -0.85
DDI1YER143W RGT1P32862 1170 aa9.76□□□□□ -0.85
DDI1YER143W CTM1P38818 585 aa9.76□□□□□ -0.85
DDI1YER143W RPN3P40016 523 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
DDI1YER143W MXR1P40029 184 aa9.76□□□□□ -0.85
DDI1YER143W YFL034WP43564 1073 aa9.76□□□□□ -0.85
DDI1YER143W CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
DDI1YER143W TOF1P53840 1238 aa9.76□□□□□ -0.85
DDI1YER143W NCS2P53923 493 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
DDI1YER143W ROD1Q02805 837 aa9.76□□□□□ -0.85
DDI1YER143W COG4Q06096 861 aa9.76□□□□□ -0.85
DDI1YER143W CUR1Q06469 252 aa9.76□□□□□ -0.85
DDI1YER143W TRM11Q12463 433 aa9.76□□□□□ -0.85
DDI1YER143W CYC8P14922 966 aa9.75□□□□□ -0.85
DDI1YER143W SEC65P29478 273 aa9.75□□□□□ -0.85
DDI1YER143W RPC25P35718 212 aa9.75□□□□□ -0.85
DDI1YER143W RPS7BP48164 190 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
DDI1YER143W HFM1P51979 1187 aa9.75□□□□□ -0.85
DDI1YER143W HUL5P53119 910 aa9.75□□□□□ -0.85
DDI1YER143W MPC54Q08550 464 aa9.75□□□□□ -0.85
DDI1YER143W MSC6Q08818 692 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
DDI1YER143W PRE10P21242 288 aaKnown RBP RIP-Chip data9.74□□□□□ -0.85not detected
DDI1YER143W MSH3P25336 1018 aa9.74□□□□□ -0.85
DDI1YER143W KIN82P25341 720 aa9.74□□□□□ -0.85
DDI1YER143W YSC83P32792 385 aa9.74□□□□□ -0.85
DDI1YER143W SPT23P35210 1082 aa9.74□□□□□ -0.85
DDI1YER143W SAP190P36123 1033 aa9.74□□□□□ -0.85
DDI1YER143W ERC1P38767 581 aa9.74□□□□□ -0.85
DDI1YER143W RTT107P38850 1070 aa9.74□□□□□ -0.85
DDI1YER143W YEL025CP39991 1188 aa9.74□□□□□ -0.85
DDI1YER143W VID30P53076 958 aa9.74□□□□□ -0.85
DDI1YER143W ATG1P53104 897 aa9.74□□□□□ -0.85
DDI1YER143W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
DDI1YER143W MED1Q12321 566 aa9.74□□□□□ -0.85
DDI1YER143W DED1P06634 604 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
DDI1YER143W EBP2P36049 427 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
DDI1YER143W VRP1P37370 817 aa9.73□□□□□ -0.85
DDI1YER143W UBP14P38237 781 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
DDI1YER143W LEO1P38439 464 aa9.73□□□□□ -0.85
DDI1YER143W DUS1P53759 423 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
DDI1YER143W COQ9Q05779 260 aa9.73□□□□□ -0.85
DDI1YER143W APL4Q12028 832 aa9.73□□□□□ -0.85
DDI1YER143W FAL1Q12099 399 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
DDI1YER143W SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data9.72□□□□□ -0.85not detected
DDI1YER143W CDC48P25694 835 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
DDI1YER143W MNN4P36044 1178 aa9.72□□□□□ -0.85
DDI1YER143W FLR1P38124 548 aa9.72□□□□□ -0.85
DDI1YER143W EFM2P38347 419 aa9.72□□□□□ -0.85
DDI1YER143W SPT8P38915 602 aa9.72□□□□□ -0.85
DDI1YER143W LCB2P40970 561 aa9.72□□□□□ -0.85
DDI1YER143W AVT1P47082 602 aa9.72□□□□□ -0.85
DDI1YER143W MET7Q08645 548 aa9.72□□□□□ -0.85
DDI1YER143W SRF1Q12516 437 aa9.72□□□□□ -0.85
DDI1YER143W PHO8P11491 566 aa9.71□□□□□ -0.86
DDI1YER143W POX1P13711 748 aa9.71□□□□□ -0.86
DDI1YER143W DBP5P20449 482 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
DDI1YER143W RPC53P25441 422 aa9.71□□□□□ -0.86
DDI1YER143W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
DDI1YER143W TIM23P32897 222 aa9.71□□□□□ -0.86
DDI1YER143W MNR2P35724 969 aa9.71□□□□□ -0.86
DDI1YER143W UBP13P38187 747 aa9.71□□□□□ -0.86
DDI1YER143W VFA1P40080 203 aa9.71□□□□□ -0.86
DDI1YER143W VPS53P47061 822 aa9.71□□□□□ -0.86
DDI1YER143W TAM41P53230 385 aa9.71□□□□□ -0.86
DDI1YER143W SPO75Q07798 868 aa9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 66.4 ms