RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeastyeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DOA4YDR069C GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
DOA4YDR069C YMR074CQ04773 145 aa3.47□□□□□ -1.85
DOA4YDR069C RSA3Q05942 220 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
DOA4YDR069C CHS5Q12114 671 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
DOA4YDR069C RVB2Q12464 471 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
DOA4YDR069C HAP1P0CE41 1502 aa3.46□□□□□ -1.85
DOA4YDR069C RPB4P20433 221 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.85
DOA4YDR069C PRP5P21372 849 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.85
DOA4YDR069C PPH3P32345 308 aa3.46□□□□□ -1.85
DOA4YDR069C YLF2P38746 405 aa3.46□□□□□ -1.85
DOA4YDR069C LAM1P38851 1228 aa3.46□□□□□ -1.85
DOA4YDR069C RTS1P38903 757 aa3.46□□□□□ -1.85
DOA4YDR069C BDH2P39713 417 aa3.46□□□□□ -1.85
DOA4YDR069C HYR1P40581 163 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.85
DOA4YDR069C LAM5P43560 674 aa3.46□□□□□ -1.85
DOA4YDR069C CEX1Q12453 761 aa3.46□□□□□ -1.85
DOA4YDR069C BPT1P14772 1559 aa3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C CDC37P06101 506 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C GAL11P19659 1081 aa3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C VPS1P21576 704 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C OPI1P21957 404 aa3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C MFT1P33441 392 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C MIC60P36112 540 aa3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C PAM1P37304 830 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YRO2P38079 344 aa3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C AMN1P38285 549 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C LIN1P38852 340 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SBE2P42223 864 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C IOC3P43596 787 aa3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C NSG2P53898 299 aa3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C FUS2Q05670 677 aa3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TY4A-HQ6Q5P6 413 aa3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C VPS15P22219 1454 aa3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YSP2Q06681 1438 aa3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ADE6P38972 1358 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C HTS1P07263 546 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C NAT1P12945 854 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C PUF4P25339 888 aaKnown RBP RIP-Chip data3.46□□□□□ -1.86not detected
DOA4YDR069C RPN2P32565 945 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C MAE1P36013 669 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C RRM3P38766 723 aa3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C PEX28P38848 579 aa3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C NOC2P39744 710 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ARB1P40024 610 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C BUD27P43573 796 aaKnown RBP RIP-Chip data3.46□□□□□ -1.86not detected
DOA4YDR069C JSN1P47135 1091 aaKnown RBP RIP-Chip data3.46□□□□□ -1.86not detected
DOA4YDR069C YML108WQ03759 105 aa3.46□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C CAT8P39113 1433 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YOR1P53049 1477 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C KAR9P32526 644 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C PET112P33893 541 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YEL1P34225 687 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C MRPL40P36534 297 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C MET12P46151 657 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C COP1P53622 1201 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C CWC24P53769 259 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C NAB6Q03735 1134 aaKnown RBP RIP-Chip data3.45□□□□□ -1.86not detected
DOA4YDR069C VMS1Q04311 632 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TAP42Q04372 366 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C RRN11Q04712 507 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C RRP9Q06506 573 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C RKM4Q12504 494 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C HVG1P0CE11 249 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C PET122P10355 254 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TAL1P15019 335 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C MRP8P35719 219 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C LHS1P36016 881 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C NMD3P38861 518 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C VPS8P39702 1274 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C VID28P40547 921 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C DSE4P53753 1117 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ECM11Q04110 302 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SPN1Q06505 410 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ELG1Q12050 791 aa3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C RIO1Q12196 484 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C CDC25P04821 1589 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C CLN2P20438 545 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SEC15P22224 910 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C STE11P23561 717 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C RME1P32338 300 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C RPN12P32496 274 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ARC19P33204 171 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C NIP100P33420 868 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C PEX5P35056 612 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ETP1P38748 585 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C SSZ1P38788 538 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C FTR1P40088 404 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C RRT14P40470 206 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C HST1P53685 503 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C PDS5Q04264 1277 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C RIX7Q07844 837 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C YPL225WQ08971 146 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C RTC5Q12108 567 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C ATG9Q12142 997 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C TY3B-GQ99315 1547 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C MER1P16523 270 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C MEF1P25039 761 aa3.44□□□□□ -1.86
DOA4YDR069C RAD27P26793 382 aa3.44□□□□□ -1.86
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