RNA–Protein interactions for RNA: YPR069C

SPE3, Transcript of Spermidine synthase, yeastyeast

Gene SPE3, Length 882 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3YPR069C AIM33Q04516 312 aa7.9□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C SVF1Q05515 481 aa7.9□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C HIF1Q12373 385 aa7.9□□□□□ -1.14
SPE3YPR069C GAA1P39012 614 aa7.89□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C CIT3P43635 486 aa7.89□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C VID30P53076 958 aa7.89□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C CSM3Q04659 317 aa7.89□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C SMD2Q06217 110 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C HFI1Q12060 488 aa7.89□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C RAD59Q12223 238 aa7.89□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C FMP27Q06179 2628 aa7.89□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C ILV1P00927 576 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C DED1P06634 604 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C MATALPHA2P0CY08 210 aa7.88□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C HMLALPHA2P0CY09 210 aa7.88□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C DID4P36108 232 aa7.88□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C MRPL7P36519 292 aa7.88□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C YHL026CP38740 315 aa7.88□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C FIS1P40515 155 aa7.88□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C VID28P40547 921 aa7.88□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C JJJ3P47138 172 aa7.88□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C GIS4Q04233 774 aa7.88□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C COQ9Q05779 260 aa7.88□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C CEX1Q12453 761 aa7.88□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C PRC1P00729 532 aa7.87□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C CLN3P13365 580 aa7.87□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C PRP22P24384 1145 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C ESL1P40456 1118 aa7.87□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C BRE2P43132 505 aa7.87□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C YFL052WP43551 465 aa7.87□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C ACF4P47129 309 aa7.87□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C YKE2P52553 114 aa7.87□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C DSE4P53753 1117 aa7.87□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C NAF1P53919 492 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C ROD1Q02805 837 aa7.87□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C SMC5Q08204 1093 aa7.87□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C BEM2P39960 2167 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C SUP45P12385 437 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C ADE2P21264 571 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C CBP3P21560 335 aa7.86□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C MBR1P23493 339 aa7.86□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C CDC48P25694 835 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C ASF1P32447 279 aa7.86□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C RFS1P38234 210 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C UBX7P38349 436 aa7.86□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C FAF1P40546 346 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C EPL1P43572 832 aa7.86□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C YJL045WP47052 634 aa7.86□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C DIP5P53388 608 aa7.86□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C YNL134CP53912 376 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C LCD1Q04377 747 aa7.86□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C PCD1Q12524 340 aa7.86□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C WHI2P12611 486 aa7.85□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C THR4P16120 514 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C ORC6P38826 435 aa7.85□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C RPN10P38886 268 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C EAF5P39995 279 aa7.85□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C MMF1P40185 145 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C ATG32P40458 529 aa7.85□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C HUL4P40985 892 aa7.85□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C TRL1P09880 827 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C HCA4P20448 770 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C ADK2P26364 225 aa7.84□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C BIO2P32451 375 aa7.84□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C TMT1P32643 299 aa7.84□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C ALT2P52892 507 aa7.84□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C YLR407WQ06070 228 aa7.84□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C PIG1Q06216 648 aa7.84□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C LAA1P39526 2014 aa7.84□□□□□ -1.15
SPE3YPR069C SRD1P09007 221 aa7.83□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C CDC6P09119 513 aa7.83□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C GSY1P23337 708 aa7.83□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C SAF1P38352 637 aa7.83□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C YHR202WP38887 602 aa7.83□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C KRI1P42846 591 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C ART5P53244 586 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C ARP5P53946 755 aa7.83□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C DOT1Q04089 582 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C FUS2Q05670 677 aa7.83□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C SLK19Q08581 821 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C TCP1P12612 559 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C DPH2P32461 534 aa7.82□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C STT3P39007 718 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C FYV10P40492 516 aa7.82□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C ROG3P43602 733 aa7.82□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C NCR1Q12200 1170 aa7.82□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C VPS1P21576 704 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C APM2P38700 605 aa7.81□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C TRS120Q04183 1289 aa7.81□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C TIP41Q12199 356 aa7.81□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C GLN3P18494 730 aa7.8□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C PPZ1P26570 692 aa7.8□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C COQ8P27697 501 aa7.8□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C SEC21P32074 935 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C RPT1P33299 467 aaKnown RBP7.8□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C LAM5P43560 674 aa7.8□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C SPP1Q03012 353 aa7.8□□□□□ -1.16
SPE3YPR069C KEX2P13134 814 aa7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 190.5 ms