RNA–Protein interactions for RNA: YML014W

TRM9, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM9, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM9	YML014W	TFC4	P33339	1025 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	PIH1	P38768	344 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	MXR1	P40029	184 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	BRE2	P43132	505 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	UBP15	P50101	1230 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	ATG1	P53104	897 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	GUP1	P53154	560 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	SVF1	Q05515	481 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	DUS4	Q06063	367 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	SAP190	P36123	1033 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	TVP38	P36164	337 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	FIS1	P40515	155 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	YFL034W	P43564	1073 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	OM45	P16547	393 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	RGT1	P32862	1170 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	PPS1	P38148	807 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	PSY4	P38193	441 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	VPS53	P47061	822 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	SRF1	Q12516	437 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TRM9	YML014W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	MRC1	P25588	1096 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	MCM2	P29469	868 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	MGA2	P40578	1113 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	CTR1	P49573	406 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	VID30	P53076	958 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	PSO2	P30620	661 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	TMA16	Q08687	178 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	TFC8	Q12308	588 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	PCK1	P10963	549 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	TIM23	P32897	222 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	ATG19	P35193	415 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	MDR1	P53258	950 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	LSC2	P53312	427 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	COG4	Q06096	861 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	CUR1	Q06469	252 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	MET7	Q08645	548 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	TRM11	Q12463	433 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	YET1	P35723	206 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	UBP13	P38187	747 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	CTM1	P38818	585 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	HUL4	P40985	892 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	SMC5	Q08204	1093 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	TCO89	Q08921	799 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	YPL277C	Q08989	487 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	MED1	Q12321	566 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	TOM1	Q03280	3268 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	13.91	□□□□□ -0.18	not detected
TRM9	YML014W	MSH3	P25336	1018 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	YEL025C	P39991	1188 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	YMR321C	Q04898	105 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	VPS35	P34110	944 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	VPS75	P53853	264 aa		13.9	□□□□□ -0.18
TRM9	YML014W	CYC8	P14922	966 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	YUR1	P26725	428 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	TOF1	P53840	1238 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	YDL057W	Q07379	328 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	YOL075C	Q08234	1294 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	YLL058W	Q12198	575 aa		13.89	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	RPC53	P25441	422 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	SPC110	P32380	944 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	SPT8	P38915	602 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	BIM1	P40013	344 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	YAP7	Q08182	245 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	YPL216W	Q08964	1102 aa		13.88	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	PHO13	P19881	312 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	DAL7	P21826	554 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	COT1	P32798	439 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	LEO1	P38439	464 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	TOS3	P43637	560 aa		13.87	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	PHO8	P11491	566 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	SPO11	P23179	398 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	NCS6	P53088	359 aa		13.86	□□□□□ -0.19
TRM9	YML014W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19

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