RNA–Protein interactions for RNA: YJL194W

CDC6, Transcript of Essential ATP-binding protein required for DNA replication, yeast

Gene CDC6, Length 1,542 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CDC6	YJL194W	CUZ1	P53899	274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	KRE33	P53914	1056 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	PKH1	Q03407	766 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	ADI1	Q03677	179 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	MED1	Q12321	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	PHO81	P17442	1178 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	NUP120	P35729	1037 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	BET3	P36149	193 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	PES4	P39684	611 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	MEP1	P40260	492 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	BTN2	P53286	410 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	EEB1	Q02891	456 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	HEH2	Q03281	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	IRC3	Q06683	689 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	YDL176W	Q12027	708 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	HSP42	Q12329	375 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	AEP2	P22136	580 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
CDC6	YJL194W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	ECM2	P38241	364 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	APM2	P38700	605 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	CAJ1	P39101	391 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	HIS6	P40545	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	ULP1	Q02724	621 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	VPS30	Q02948	557 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	OPY2	Q06810	360 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	MEF1	P25039	761 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	KCC4	P25389	1037 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	IMP2'	P32351	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	SCT1	P32784	759 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	YKL100C	P34248	587 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	SQT1	P35184	431 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	BSD2	P38356	321 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	YHL041W	P38730	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	CEM1	P39525	442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	XKS1	P42826	600 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	RGD2	P43556	714 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	YGR016W	P53209	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	HOL1	P53389	586 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	FPS1	P23900	669 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	VBA3	P25594	458 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	UGA4	P32837	571 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	SEA4	P38164	1038 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	RXT2	P38255	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	CCC2	P38995	1004 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	LYS5	P50113	272 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	VTI1	Q04338	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDC6	YJL194W	FLP1	P03870	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.63	not detected
CDC6	YJL194W	KTR4	P38131	464 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	PIC2	P40035	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	PSY2	P40164	858 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	BFA1	P47113	574 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	RSM26	P47141	266 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	SGM1	P47166	707 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	MAL11	P53048	616 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	MDM12	Q92328	271 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	MRP7	P12687	371 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	PFK1	P16861	987 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	ACE2	P21192	770 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	RER1	P25560	188 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	AAD3	P25612	363 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	MGS1	P40151	587 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	MON1	P53129	644 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	PSR1	Q07800	427 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	SPO21	Q12411	609 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	ENT1	Q12518	454 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	IDI1	P15496	288 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	PGS1	P25578	521 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	LYP1	P32487	611 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	MSC7	P38694	644 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	AIM46	P38885	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CDC6	YJL194W	VPS8	P39702	1274 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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