RNA–Protein interactions for RNA: YHR167W

THP2, Transcript of Subunit of the THO and TREX complexes, yeast

Gene THP2, Length 786 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
THP2	YHR167W	NSE3	Q05541	303 aa		5.11	□□□□□ -1.59
THP2	YHR167W	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.11	□□□□□ -1.59
THP2	YHR167W	BDF2	Q07442	638 aa		5.11	□□□□□ -1.59
THP2	YHR167W	SPS1	P08458	490 aa		5.1	□□□□□ -1.59
THP2	YHR167W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
THP2	YHR167W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
THP2	YHR167W	ATG13	Q06628	738 aa		5.1	□□□□□ -1.59
THP2	YHR167W	RSB1	Q08417	382 aa		5.1	□□□□□ -1.59
THP2	YHR167W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
THP2	YHR167W	TIM54	P47045	478 aa		5.09	□□□□□ -1.59
THP2	YHR167W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
THP2	YHR167W	RIB2	Q12362	591 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
THP2	YHR167W	ACE2	P21192	770 aa		5.08	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	MTC3	P53077	123 aa		5.08	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	HUL5	P53119	910 aa		5.08	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	SVS1	Q12254	260 aa		5.08	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	YDL177C	Q12257	170 aa		5.08	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	DFG16	Q99234	619 aa		5.08	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.07	□□□□□ -1.6	not detected
THP2	YHR167W	YDR306C	Q06640	478 aa		5.07	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	UBX5	Q06682	500 aa		5.07	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	YTA7	P40340	1379 aa		5.06	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
THP2	YHR167W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	NPP2	P39997	493 aa		5.06	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	RRT14	P40470	206 aa		5.06	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	ALR2	P43553	858 aa		5.06	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	HFM1	P51979	1187 aa		5.06	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	ERP6	P53198	216 aa		5.06	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	EAF1	Q06337	982 aa		5.06	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	SPO75	Q07798	868 aa		5.06	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	MDM38	Q08179	573 aa		5.06	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	YLL058W	Q12198	575 aa		5.06	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	CIT1	P00890	479 aa		5.05	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	AFR1	P33304	620 aa		5.05	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	RFC5	P38251	354 aa		5.05	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	GIC1	P38785	314 aa		5.05	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	FOL2	P51601	243 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	PPM2	Q08282	695 aa		5.05	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	FLC1	Q08967	793 aa		5.05	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	OSH2	Q12451	1283 aa		5.05	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	UBP5	P39944	805 aa		5.04	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	SIT1	P39980	628 aa		5.04	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	ENV11	P53246	860 aa		5.04	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	YGR125W	P53273	1036 aa		5.04	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	XYL2	Q07993	356 aa		5.04	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	SRM1	P21827	482 aa		5.03	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	NPP1	P25353	742 aa		5.03	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	ARE1	P25628	610 aa		5.03	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	CCC2	P38995	1004 aa		5.03	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	SRT1	Q03175	343 aa		5.03	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	RPN4	Q03465	531 aa		5.03	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	TAF8	Q03750	510 aa		5.03	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	SIZ1	Q04195	904 aa		5.03	□□□□□ -1.6
THP2	YHR167W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	APL1	P27351	700 aa		5.02	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	PPH3	P32345	308 aa		5.02	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	ERT1	P38140	529 aa		5.02	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	PBP2	P38151	413 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.02	□□□□□ -1.61	not detected
THP2	YHR167W	BUD6	P41697	788 aa		5.02	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	ECL1	P48235	211 aa		5.02	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	TPO2	P53283	614 aa		5.02	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.02	□□□□□ -1.61	not detected
THP2	YHR167W	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.02	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	FUN30	P31380	1131 aa		5.01	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	YBR284W	P38150	797 aa		5.01	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	YAP1801	P38856	637 aa		5.01	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	GYP7	P48365	746 aa		5.01	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	MSC2	Q03455	724 aa		5.01	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	RSM24	Q03976	319 aa		5.01	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	CAN1	P04817	590 aa		5	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	TOP3	P13099	656 aa		5	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	CMP2	P14747	604 aa		5	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	BET3	P36149	193 aa		5	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	YRO2	P38079	344 aa		5	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	RTA1	P53047	317 aa		5	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	SFB2	P53953	876 aa		5	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	CDA2	Q06703	312 aa		5	□□□□□ -1.61
THP2	YHR167W	OSW2	Q12202	724 aa		5	□□□□□ -1.61

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