RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000142312.2

Hoxd11-202, Transcript of Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd11, Length 1,111 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ttc21aQ8C0S4 1314 aa27.52■■■□□ 2
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Anks4bQ8K3X6 423 aa27.52■■■□□ 2
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Golgb1E9PVZ8 3238 aa27.48■■□□□ 1.99
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Klrk1O54709 232 aa27.47■■□□□ 1.99
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Atp1b3P97370 278 aa27.47■■□□□ 1.99
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 SobpQ0P5V2 864 aa27.45■■□□□ 1.98
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ccdc30Q8BVF4 654 aa27.45■■□□□ 1.98
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Slc39a6Q8C145 765 aa27.45■■□□□ 1.98
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Prr5lA2AVJ5 370 aa27.44■■□□□ 1.98
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Morc2aQ69ZX6 1030 aa27.44■■□□□ 1.98
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 EgfrQ01279 1210 aa27.43■■□□□ 1.98
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Dpf1Q9QX66 387 aa27.43■■□□□ 1.98
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Lama4P97927 1816 aa27.42■■□□□ 1.98
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Strn4P58404 760 aa27.42■■□□□ 1.98
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ksr2Q3UVC0 959 aa27.42■■□□□ 1.98
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Wdhd1P59328 1117 aa27.41■■□□□ 1.98
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Slurp2P0DP59 97 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Rbm46P86049 533 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Trim52Q8CDV4 233 aa27.4■■□□□ 1.98
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Esco1Q69Z69 843 aa27.39■■□□□ 1.98
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Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ppp1r1bQ60829 194 aa27.38■■□□□ 1.97
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 WasP70315 520 aa27.37■■□□□ 1.97
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa27.36■■□□□ 1.97
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Slf2Q6P9P0 1278 aa27.36■■□□□ 1.97
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Ubn2Q80WC1 1314 aa27.36■■□□□ 1.97
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 XpcP51612 930 aa27.34■■□□□ 1.97
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Cnksr1A2A9K7 700 aa27.33■■□□□ 1.97
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Gjd4Q8BSD4 364 aa27.33■■□□□ 1.97
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa27.33■■□□□ 1.97
Hoxd11-202ENSMUST00000142312 Nkx1-1G3UXB3 402 aa27.32■■□□□ 1.96
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