Protein–RNA interactions for Protein: G3X9J0

Sipa1l3, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sipa1l3G3X9J0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.91■■■■■ 5.42
Sipa1l3G3X9J0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Sipa1l3G3X9J0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
Sipa1l3G3X9J0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.76■■■■■ 4.44
Sipa1l3G3X9J0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.66■■■■■ 4.42
Sipa1l3G3X9J0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
Sipa1l3G3X9J0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Sipa1l3G3X9J0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
Sipa1l3G3X9J0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
Sipa1l3G3X9J0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Sipa1l3G3X9J0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Sipa1l3G3X9J0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Sipa1l3G3X9J0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
Sipa1l3G3X9J0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
Sipa1l3G3X9J0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
Sipa1l3G3X9J0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
Sipa1l3G3X9J0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Sipa1l3G3X9J0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
Sipa1l3G3X9J0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Sipa1l3G3X9J0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Sipa1l3G3X9J0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.11■■■■□ 3.85
Sipa1l3G3X9J0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
Sipa1l3G3X9J0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
Sipa1l3G3X9J0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
Sipa1l3G3X9J0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Sipa1l3G3X9J0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Sipa1l3G3X9J0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Sipa1l3G3X9J0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Sipa1l3G3X9J0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Sipa1l3G3X9J0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
Sipa1l3G3X9J0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
Sipa1l3G3X9J0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Sipa1l3G3X9J0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Sipa1l3G3X9J0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Sipa1l3G3X9J0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Sipa1l3G3X9J0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
Sipa1l3G3X9J0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Sipa1l3G3X9J0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
Sipa1l3G3X9J0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Sipa1l3G3X9J0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Sipa1l3G3X9J0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.63■■■■□ 3.61
Sipa1l3G3X9J0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Sipa1l3G3X9J0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Sipa1l3G3X9J0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Sipa1l3G3X9J0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.32■■■■□ 3.57
Sipa1l3G3X9J0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Sipa1l3G3X9J0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
Sipa1l3G3X9J0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Sipa1l3G3X9J0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Sipa1l3G3X9J0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Sipa1l3G3X9J0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Sipa1l3G3X9J0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
Sipa1l3G3X9J0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Sipa1l3G3X9J0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Sipa1l3G3X9J0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Sipa1l3G3X9J0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Sipa1l3G3X9J0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
Sipa1l3G3X9J0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
Sipa1l3G3X9J0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Sipa1l3G3X9J0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Sipa1l3G3X9J0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Sipa1l3G3X9J0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Sipa1l3G3X9J0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Sipa1l3G3X9J0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Sipa1l3G3X9J0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Sipa1l3G3X9J0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Sipa1l3G3X9J0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Sipa1l3G3X9J0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
Sipa1l3G3X9J0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
Sipa1l3G3X9J0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Sipa1l3G3X9J0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Sipa1l3G3X9J0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Sipa1l3G3X9J0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Sipa1l3G3X9J0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Sipa1l3G3X9J0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Sipa1l3G3X9J0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Sipa1l3G3X9J0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Sipa1l3G3X9J0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Sipa1l3G3X9J0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Sipa1l3G3X9J0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
Sipa1l3G3X9J0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Sipa1l3G3X9J0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Sipa1l3G3X9J0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Sipa1l3G3X9J0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Sipa1l3G3X9J0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Sipa1l3G3X9J0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Sipa1l3G3X9J0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Sipa1l3G3X9J0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Sipa1l3G3X9J0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Sipa1l3G3X9J0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Sipa1l3G3X9J0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Sipa1l3G3X9J0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Sipa1l3G3X9J0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Sipa1l3G3X9J0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Sipa1l3G3X9J0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Sipa1l3G3X9J0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Sipa1l3G3X9J0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Sipa1l3G3X9J0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Sipa1l3G3X9J0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Sipa1l3G3X9J0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms