Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.35■■■■■ 5.49
Ddx60E9PZQ1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Ddx60E9PZQ1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Ddx60E9PZQ1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
Ddx60E9PZQ1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
Ddx60E9PZQ1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.23■■■■■ 4.35
Ddx60E9PZQ1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.32
Ddx60E9PZQ1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Ddx60E9PZQ1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
Ddx60E9PZQ1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
Ddx60E9PZQ1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
Ddx60E9PZQ1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
Ddx60E9PZQ1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Ddx60E9PZQ1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
Ddx60E9PZQ1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
Ddx60E9PZQ1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Ddx60E9PZQ1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Ddx60E9PZQ1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
Ddx60E9PZQ1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
Ddx60E9PZQ1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Ddx60E9PZQ1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.44■■■■□ 3.9
Ddx60E9PZQ1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
Ddx60E9PZQ1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
Ddx60E9PZQ1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Ddx60E9PZQ1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
Ddx60E9PZQ1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
Ddx60E9PZQ1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
Ddx60E9PZQ1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
Ddx60E9PZQ1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
Ddx60E9PZQ1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Ddx60E9PZQ1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
Ddx60E9PZQ1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
Ddx60E9PZQ1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Ddx60E9PZQ1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Ddx60E9PZQ1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Ddx60E9PZQ1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Ddx60E9PZQ1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Ddx60E9PZQ1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Ddx60E9PZQ1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Ddx60E9PZQ1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
Ddx60E9PZQ1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Ddx60E9PZQ1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Ddx60E9PZQ1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Ddx60E9PZQ1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Ddx60E9PZQ1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Ddx60E9PZQ1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Ddx60E9PZQ1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Ddx60E9PZQ1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Ddx60E9PZQ1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Ddx60E9PZQ1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Ddx60E9PZQ1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Ddx60E9PZQ1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
Ddx60E9PZQ1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Ddx60E9PZQ1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Ddx60E9PZQ1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Ddx60E9PZQ1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Ddx60E9PZQ1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
Ddx60E9PZQ1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
Ddx60E9PZQ1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Ddx60E9PZQ1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
Ddx60E9PZQ1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
Ddx60E9PZQ1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ddx60E9PZQ1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
Ddx60E9PZQ1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Ddx60E9PZQ1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
Ddx60E9PZQ1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Ddx60E9PZQ1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Ddx60E9PZQ1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
Ddx60E9PZQ1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Ddx60E9PZQ1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
Ddx60E9PZQ1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Ddx60E9PZQ1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Ddx60E9PZQ1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ddx60E9PZQ1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Ddx60E9PZQ1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Ddx60E9PZQ1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Ddx60E9PZQ1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ddx60E9PZQ1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Ddx60E9PZQ1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Ddx60E9PZQ1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ddx60E9PZQ1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ddx60E9PZQ1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ddx60E9PZQ1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Ddx60E9PZQ1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Ddx60E9PZQ1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Ddx60E9PZQ1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
Ddx60E9PZQ1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Ddx60E9PZQ1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Ddx60E9PZQ1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Ddx60E9PZQ1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ddx60E9PZQ1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Ddx60E9PZQ1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Ddx60E9PZQ1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Ddx60E9PZQ1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
Ddx60E9PZQ1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Ddx60E9PZQ1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Ddx60E9PZQ1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
Ddx60E9PZQ1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
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