Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

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Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC49.47■■■■■ 5.51
Rapgef4Q9EQZ6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Rapgef4Q9EQZ6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
Rapgef4Q9EQZ6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC42.03■■■■■ 4.32
Rapgef4Q9EQZ6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Rapgef4Q9EQZ6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
Rapgef4Q9EQZ6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Rapgef4Q9EQZ6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
Rapgef4Q9EQZ6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
Rapgef4Q9EQZ6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
Rapgef4Q9EQZ6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
Rapgef4Q9EQZ6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Rapgef4Q9EQZ6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
Rapgef4Q9EQZ6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
Rapgef4Q9EQZ6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Rapgef4Q9EQZ6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Rapgef4Q9EQZ6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Rapgef4Q9EQZ6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
Rapgef4Q9EQZ6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
Rapgef4Q9EQZ6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
Rapgef4Q9EQZ6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.26■■■■□ 3.87
Rapgef4Q9EQZ6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
Rapgef4Q9EQZ6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
Rapgef4Q9EQZ6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
Rapgef4Q9EQZ6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
Rapgef4Q9EQZ6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
Rapgef4Q9EQZ6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Rapgef4Q9EQZ6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Rapgef4Q9EQZ6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Rapgef4Q9EQZ6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Rapgef4Q9EQZ6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rapgef4Q9EQZ6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rapgef4Q9EQZ6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rapgef4Q9EQZ6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rapgef4Q9EQZ6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37.7■■■■□ 3.63
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.67■■■■□ 3.62
Rapgef4Q9EQZ6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rapgef4Q9EQZ6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
Rapgef4Q9EQZ6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Rapgef4Q9EQZ6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Rapgef4Q9EQZ6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Rapgef4Q9EQZ6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Rapgef4Q9EQZ6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rapgef4Q9EQZ6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rapgef4Q9EQZ6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rapgef4Q9EQZ6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Rapgef4Q9EQZ6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Rapgef4Q9EQZ6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rapgef4Q9EQZ6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Rapgef4Q9EQZ6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rapgef4Q9EQZ6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rapgef4Q9EQZ6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Rapgef4Q9EQZ6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
Rapgef4Q9EQZ6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Rapgef4Q9EQZ6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rapgef4Q9EQZ6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rapgef4Q9EQZ6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rapgef4Q9EQZ6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rapgef4Q9EQZ6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rapgef4Q9EQZ6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Rapgef4Q9EQZ6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rapgef4Q9EQZ6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Rapgef4Q9EQZ6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rapgef4Q9EQZ6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rapgef4Q9EQZ6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Rapgef4Q9EQZ6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rapgef4Q9EQZ6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rapgef4Q9EQZ6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rapgef4Q9EQZ6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Rapgef4Q9EQZ6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Rapgef4Q9EQZ6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Rapgef4Q9EQZ6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
Rapgef4Q9EQZ6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rapgef4Q9EQZ6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Rapgef4Q9EQZ6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Rapgef4Q9EQZ6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Rapgef4Q9EQZ6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Rapgef4Q9EQZ6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rapgef4Q9EQZ6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rapgef4Q9EQZ6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rapgef4Q9EQZ6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rapgef4Q9EQZ6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rapgef4Q9EQZ6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rapgef4Q9EQZ6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rapgef4Q9EQZ6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
Rapgef4Q9EQZ6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
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