RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019577.9

Gipc1-201, Transcript of PDZ domain-containing protein GIPC1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gipc1, Length 1,522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Col4a1P02463 1669 aa28.86■■■□□ 2.21
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ttll7A4Q9F0 912 aa28.86■■■□□ 2.21
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Exoc6bA6H5Z3 810 aa28.85■■■□□ 2.21
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ubap1lG3UW59 384 aa28.85■■■□□ 2.21
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Bicc1Q99MQ1 977 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
Gipc1-201ENSMUST00000019577 HellsQ60848 821 aa28.84■■■□□ 2.21
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Fgd1P52734 960 aa28.84■■■□□ 2.21
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Clcn1Q64347 994 aa28.84■■■□□ 2.21
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Bend3Q6PAL0 825 aa28.84■■■□□ 2.21
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Nip7Q9CXK8 180 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Bicdl1A0JNT9 577 aa28.83■■■□□ 2.21
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Mphosph10Q810V0 681 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Gnl3lQ6PGG6 577 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Prr29B1ARI9 187 aa28.8■■■□□ 2.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Miga2Q8BK03 593 aa28.8■■■□□ 2.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Kdm2bQ6P1G2 1309 aa28.8■■■□□ 2.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa28.79■■■□□ 2.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ppm1mQ8BU27 406 aa28.79■■■□□ 2.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Zbtb1Q91VL9 713 aa28.79■■■□□ 2.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Sipa1l3G3X9J0 1776 aa28.78■■■□□ 2.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Zap70P43404 618 aa28.78■■■□□ 2.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Smarcc1P97496 1104 aa28.78■■■□□ 2.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ddx60E9PZQ1 1711 aa28.77■■■□□ 2.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Cfdp1O88271 295 aaKnown RBP28.77■■■□□ 2.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ddx58Q6Q899 926 aa28.77■■■□□ 2.2
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Eif3aP23116 1344 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Stk36Q69ZM6 1316 aa28.76■■■□□ 2.19
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Prkar2bP31324 416 aa28.76■■■□□ 2.19
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Vars2Q3U2A8 1060 aa28.75■■■□□ 2.19
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa28.75■■■□□ 2.19
Gipc1-201ENSMUST00000019577 MypnQ5DTJ9 1315 aa28.75■■■□□ 2.19
Gipc1-201ENSMUST00000019577 CoblQ5NBX1 1337 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Gnai2P08752 355 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Q8BT18 775 aa28.73■■■□□ 2.19
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Rlbp1Q9Z275 317 aa28.73■■■□□ 2.19
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Tm6sf1P58749 370 aa28.72■■■□□ 2.19
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Triml2E9PW10 424 aa28.71■■■□□ 2.19
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Hspa2P17156 633 aa28.71■■■□□ 2.19
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ankrd13dQ6PD24 605 aa28.7■■■□□ 2.19
Gipc1-201ENSMUST00000019577 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.19
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Hs1bp3Q3TC93 395 aa28.69■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 MpndQ3TV65 487 aa28.69■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Fkbp5Q64378 456 aa28.69■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 C4bP01029 1738 aa28.69■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Gm13023A2A8N2 498 aa28.69■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Lrrc43Q3V0L5 667 aa28.69■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Mum1Q6DID5 682 aa28.69■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 AbraQ8BUZ1 375 aa28.69■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Nlrp3Q8R4B8 1033 aa28.69■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Prr5lA2AVJ5 370 aa28.68■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Map3k13Q1HKZ5 959 aa28.68■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Lmbr1lQ9D1E5 489 aa28.68■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Grm8P47743 908 aa28.66■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ank1Q02357 1862 aa28.66■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Snapc4Q8BP86 1333 aa28.66■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Pim2Q62070 370 aa28.65■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 AK157302I3ITR1 129 aa28.64■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ripor2Q80U16 1078 aa28.64■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Isca1Q9D924 129 aa28.64■■■□□ 2.18
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Esco1Q69Z69 843 aa28.64■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Cluap1Q8R3P7 413 aa28.64■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Lama4P97927 1816 aa28.63■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Col22a1E9Q7P1 1613 aa28.63■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa28.63■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Smc5Q8CG46 1101 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Stard3nlQ9DCI3 235 aa28.63■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ehd4Q9EQP2 541 aa28.63■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Cwc25Q9DBF7 416 aa28.62■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Myd88P22366 296 aa28.61■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ppp4r2Q0VGB7 417 aa28.61■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Soga3Q6NZL0 945 aa28.61■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa28.61■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ssc5dQ8BV57 1371 aa28.61■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 AU019823E9PUQ3 292 aa28.6■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Atp8b2P98199 1209 aa28.6■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Atl3Q91YH5 541 aa28.6■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Tceal9Q9DD24 104 aa28.6■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Mrc1Q61830 1456 aa28.6■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Fkbp1aP26883 108 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Fam13aQ8BGI4 693 aa28.59■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Slfnl1Q8BHW9 410 aa28.59■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa28.59■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Strn4P58404 760 aa28.59■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Slf2Q6P9P0 1278 aa28.59■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Armcx1Q9CX83 456 aa28.59■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Arap2Q8BZ05 1703 aa28.58■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 NmiO35309 314 aa28.58■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Wwc1Q5SXA9 1104 aa28.58■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Trim27Q62158 513 aa28.58■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Dpf1Q9QX66 387 aa28.58■■■□□ 2.17
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Nsfl1cQ9CZ44 370 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa28.56■■■□□ 2.16
Gipc1-201ENSMUST00000019577 RtcbQ99LF4 505 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
Gipc1-201ENSMUST00000019577 Zfyve9A2A8R0 1397 aa28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.2 ms