Protein–RNA interactions for Protein: Q9D924

Isca1, Iron-sulfur cluster assembly 1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isca1Q9D924 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC48.32■■■■■ 5.33
Isca1Q9D924 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
Isca1Q9D924 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
Isca1Q9D924 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC42.21■■■■■ 4.35
Isca1Q9D924 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
Isca1Q9D924 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
Isca1Q9D924 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
Isca1Q9D924 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
Isca1Q9D924 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Isca1Q9D924 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Isca1Q9D924 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Isca1Q9D924 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC40.3■■■■■ 4.04
Isca1Q9D924 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
Isca1Q9D924 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Isca1Q9D924 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Isca1Q9D924 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
Isca1Q9D924 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
Isca1Q9D924 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Isca1Q9D924 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
Isca1Q9D924 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Isca1Q9D924 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Isca1Q9D924 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC38.8■■■■□ 3.8
Isca1Q9D924 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Isca1Q9D924 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Isca1Q9D924 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Isca1Q9D924 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Isca1Q9D924 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Isca1Q9D924 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Isca1Q9D924 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Isca1Q9D924 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
Isca1Q9D924 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Isca1Q9D924 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Isca1Q9D924 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Isca1Q9D924 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Isca1Q9D924 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Isca1Q9D924 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Isca1Q9D924 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Isca1Q9D924 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Isca1Q9D924 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Isca1Q9D924 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Isca1Q9D924 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Isca1Q9D924 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Isca1Q9D924 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Isca1Q9D924 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Isca1Q9D924 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Isca1Q9D924 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
Isca1Q9D924 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Isca1Q9D924 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Isca1Q9D924 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Isca1Q9D924 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
Isca1Q9D924 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Isca1Q9D924 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Isca1Q9D924 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Isca1Q9D924 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Isca1Q9D924 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Isca1Q9D924 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Isca1Q9D924 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
Isca1Q9D924 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
Isca1Q9D924 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Isca1Q9D924 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Isca1Q9D924 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Isca1Q9D924 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Isca1Q9D924 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Isca1Q9D924 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Isca1Q9D924 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Isca1Q9D924 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Isca1Q9D924 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
Isca1Q9D924 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Isca1Q9D924 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Isca1Q9D924 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Isca1Q9D924 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Isca1Q9D924 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Isca1Q9D924 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Isca1Q9D924 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Isca1Q9D924 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Isca1Q9D924 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Isca1Q9D924 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Isca1Q9D924 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Isca1Q9D924 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Isca1Q9D924 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Isca1Q9D924 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Isca1Q9D924 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Isca1Q9D924 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Isca1Q9D924 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Isca1Q9D924 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Isca1Q9D924 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Isca1Q9D924 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Isca1Q9D924 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Isca1Q9D924 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Isca1Q9D924 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
Isca1Q9D924 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Isca1Q9D924 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Isca1Q9D924 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Isca1Q9D924 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Isca1Q9D924 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Isca1Q9D924 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Isca1Q9D924 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Isca1Q9D924 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Isca1Q9D924 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Isca1Q9D924 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms