RNA–Protein interactions for RNA: YOR087W

YVC1, Transcript of Vacuolar cation channel, yeast

Gene YVC1, Length 2,028 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YVC1	YOR087W	SPO71	Q03868	1245 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	GRX7	P38068	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	TPM2	P40414	161 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	CUZ1	P53899	274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	YOL057W	Q08225	711 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	LAP2	Q10740	671 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	PTC5	Q12511	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	MLS1	P30952	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
YVC1	YOR087W	PMT3	P47190	753 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	LYS5	P50113	272 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	GCR2	Q01722	534 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	ATG13	Q06628	738 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	TRK1	P12685	1235 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	DOM34	P33309	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	PAN5	P38787	379 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	ROG3	P43602	733 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	VPS53	P47061	822 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	YNR063W	P53749	607 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	MDM12	Q92328	271 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	HSE1	P38753	452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	YAR028W	P39548	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	BRE2	P43132	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	SPO74	P45819	413 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	YNL193W	P53870	558 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	YDR306C	Q06640	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	SLP1	Q12232	587 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	TOP3	P13099	656 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	GSY1	P23337	708 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	SIT1	P39980	628 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	YGR237C	P50089	785 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
YVC1	YOR087W	GIP2	P40036	548 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	SYT1	Q06836	1226 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	NUP145	P49687	1317 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YVC1	YOR087W	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	PET10	P36139	283 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	YBR284W	P38150	797 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	CEM1	P39525	442 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	FOL1	P53848	824 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	MEF1	P25039	761 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	DSS1	P39112	969 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	POL5	P39985	1022 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	SAC7	P17121	654 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	NFS1	P25374	497 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	PPH3	P32345	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	PNT1	P38969	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	UME1	Q03010	460 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	YMR074C	Q04773	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	THI73	Q07904	523 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	ELG1	Q12050	791 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	RAD53	P22216	821 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	ALG2	P43636	503 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	GIS4	Q04233	774 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	TMA17	Q12513	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	ADE8	P04161	214 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	YGR045C	P53229	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	LCD1	Q04377	747 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	YLR001C	Q07895	862 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	YPR071W	Q12346	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	YER152C	P10356	443 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	VBA3	P25594	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	KNS1	P32350	737 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	TED1	P40533	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	SPO21	Q12411	609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	PDC5	P16467	563 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	NAR1	P23503	491 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	KIP1	P28742	1111 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	SEC6	P32844	805 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	YRO2	P38079	344 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	SEC26	P41810	973 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	PEX8	P53248	589 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YVC1	YOR087W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63

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