RNA–Protein interactions for RNA: YMR093W

UTP15, Transcript of Nucleolar protein, yeast

Gene UTP15, Length 1,542 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP15	YMR093W	NSI1	Q12457	570 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	AIM44	Q99299	758 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	CHS2	P14180	963 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	YKL069W	P36088	180 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	SEA4	P38164	1038 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	YGL176C	P46945	554 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	SPO75	Q07798	868 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	MCA1	Q08601	432 aa		4.13	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
UTP15	YMR093W	SRP40	P32583	406 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	KAE1	P36132	386 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	VBA5	P36172	582 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	PBY1	P38254	753 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	IRR1	P40541	1150 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	YJL045W	P47052	634 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	TNA1	P53322	534 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	ORC1	P54784	914 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	COQ4	O13525	335 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	RAD4	P14736	754 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	YSC84	P32793	468 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	RCM1	P53972	490 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	EAR1	Q03212	550 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	NSE3	Q05541	303 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	ESC2	Q06340	456 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	YLR122C	Q12312	125 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	YVC1	Q12324	675 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	YER152C	P10356	443 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	MDL2	P33311	773 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	YHL012W	P38709	493 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	NMD3	P38861	518 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	TAT2	P38967	592 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	GPB2	P39717	880 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	YPL066W	Q12194	479 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	CCZ1	P38273	704 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	YBR184W	P38299	523 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	TIM54	P47045	478 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	YKL091C	P33324	310 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	PNT1	P38969	423 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	GEM1	P39722	662 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	IOC3	P43596	787 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	OSW7	P43611	510 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	ERP6	P53198	216 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	BDF2	Q07442	638 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
UTP15	YMR093W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	STE5	P32917	917 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	BAP2	P38084	609 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	PIK1	P39104	1066 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	MBP1	P39678	833 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	SIP5	P40210	489 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	TPO2	P53283	614 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	FMP25	Q08023	583 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	TRE1	Q08919	783 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	ACM1	Q08981	209 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	SAM35	P14693	329 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	SNF5	P18480	905 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	RPL8B	P29453	256 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	HUL5	P53119	910 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	YGR130C	P53278	816 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	RPN4	Q03465	531 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	PEX7	P39108	375 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	YGR125W	P53273	1036 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.06	□□□□□ -1.76	not detected
UTP15	YMR093W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	EAF1	Q06337	982 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	MED7	Q08278	222 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	RSB1	Q08417	382 aa		4.06	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	CYC7	P00045	113 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	CIT1	P00890	479 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	ARE1	P25628	610 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	CDC11	P32458	415 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	MXR1	P40029	184 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	PFD1	P46988	109 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	RSC58	Q07979	502 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	FLC1	Q08967	793 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	GAL11	P19659	1081 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	ADP1	P25371	1049 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	PRO1	P32264	428 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	SLA2	P33338	968 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UTP15	YMR093W	UGA2	P38067	497 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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