RNA–Protein interactions for RNA: YGL171W

ROK1, Transcript of RNA-dependent ATPase, yeast

Gene ROK1, Length 1,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ROK1	YGL171W	RRN3	P36070	627 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	APE4	P38821	490 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	HXT10	P43581	546 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	VTC2	P43585	828 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	KXD1	P53158	218 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
ROK1	YGL171W	HEH2	Q03281	663 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	IRC3	Q06683	689 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	MED1	Q12321	566 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	SPS1	P08458	490 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	PRP5	P21372	849 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	KCC4	P25389	1037 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	VBA3	P25594	458 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	CHS3	P29465	1165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	LYP1	P32487	611 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	SCD5	P34758	872 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	CLA4	P48562	842 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	SPC19	Q03954	165 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	YLR352W	Q06479	807 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	PSR1	Q07800	427 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	TOP3	P13099	656 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	MSN1	P22148	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	RER2	P35196	286 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	YKL133C	P36066	463 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	LDH1	P38139	375 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	HXT13	P39924	564 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	SUM1	P46676	1062 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	HXT17	P53631	564 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	HXT15	P54854	567 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	YPQ2	Q06328	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	COB	P00163	385 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	IMP2'	P32351	346 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	ABZ1	P37254	787 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	TMA108	P40462	946 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	HOL1	P53389	586 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	CTR9	P89105	1077 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	HDA2	Q06629	674 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	HBN1	Q96VH4	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	CYB2	P00175	591 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	MCM1	P11746	286 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	AEP2	P22136	580 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	NUP120	P35729	1037 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	APM2	P38700	605 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	CCC2	P38995	1004 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	FIR1	P40020	876 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	HIS6	P40545	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	NIT2	P47016	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	NUT1	P53114	1132 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	VPS30	Q02948	557 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	PHM6	Q05637	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	ANP1	P32629	500 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	DUR3	P33413	735 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	YJR096W	P47137	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	RSM26	P47141	266 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	MET13	P53128	600 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	NPY1	P53164	384 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	CTF4	Q01454	927 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	ISU1	Q03020	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	SDH5	Q08230	162 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	DAT1	P13483	248 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	GSY1	P23337	708 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	BRF1	P29056	596 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	TPD3	P31383	635 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	SQT1	P35184	431 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	TBS1	P38114	1094 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	DYS1	P38791	387 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	MBP1	P39678	833 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	ACA1	P39970	489 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	MEP1	P40260	492 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	ERR3	P42222	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	IML2	P47031	731 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	GPI8	P49018	411 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	MEP3	P53390	489 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ROK1	YGL171W	ERO1	Q03103	563 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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