RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W CIT3P43635 486 aa10.02□□□□□ -0.81
DDI1YER143W RRT6P53117 311 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
DDI1YER143W RSC1P53236 928 aa10.02□□□□□ -0.81
DDI1YER143W LSB1P53281 241 aa10.02□□□□□ -0.81
DDI1YER143W EIS1Q05050 843 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
DDI1YER143W SMD2Q06217 110 aaKnown RBP10.02□□□□□ -0.81
DDI1YER143W PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data10.01□□□□□ -0.81not detected
DDI1YER143W RAD18P10862 487 aa10.01□□□□□ -0.81
DDI1YER143W THR4P16120 514 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
DDI1YER143W OCT1P35999 772 aa10.01□□□□□ -0.81
DDI1YER143W YKT6P36015 200 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
DDI1YER143W TPM2P40414 161 aa10.01□□□□□ -0.81
DDI1YER143W DAK2P43550 591 aa10.01□□□□□ -0.81
DDI1YER143W YJL007CP47080 104 aa10.01□□□□□ -0.81
DDI1YER143W PML39Q03760 334 aa10.01□□□□□ -0.81
DDI1YER143W TRS120Q04183 1289 aa10.01□□□□□ -0.81
DDI1YER143W NBL1Q3E7Y6 73 aa10.01□□□□□ -0.81
DDI1YER143W RPL22AP05749 121 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
DDI1YER143W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
DDI1YER143W BMH1P29311 267 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
DDI1YER143W TGL1P34163 548 aa10□□□□□ -0.81
DDI1YER143W ATG32P40458 529 aa10□□□□□ -0.81
DDI1YER143W FMS1P50264 508 aa10□□□□□ -0.81
DDI1YER143W TMA64Q04600 565 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
DDI1YER143W UBX5Q06682 500 aa10□□□□□ -0.81
DDI1YER143W SLK19Q08581 821 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
DDI1YER143W AI4P03878 556 aa9.99□□□□□ -0.81
DDI1YER143W PER1P25625 357 aa9.99□□□□□ -0.81
DDI1YER143W SRP40P32583 406 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
DDI1YER143W UGA4P32837 571 aa9.99□□□□□ -0.81
DDI1YER143W SAS3P34218 831 aa9.99□□□□□ -0.81
DDI1YER143W PRE3P38624 215 aa9.99□□□□□ -0.81
DDI1YER143W DSE4P53753 1117 aa9.99□□□□□ -0.81
DDI1YER143W BNI5P53890 448 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
DDI1YER143W SSL2Q00578 843 aa9.99□□□□□ -0.81
DDI1YER143W HIS4P00815 799 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
DDI1YER143W ATE1P16639 503 aa9.98□□□□□ -0.81
DDI1YER143W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data9.98□□□□□ -0.81not detected
DDI1YER143W SUL1P38359 859 aa9.98□□□□□ -0.81
DDI1YER143W THI6P41835 540 aa9.98□□□□□ -0.81
DDI1YER143W LCD1Q04377 747 aa9.98□□□□□ -0.81
DDI1YER143W AIM33Q04516 312 aa9.98□□□□□ -0.81
DDI1YER143W SRO9P25567 434 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
DDI1YER143W GAA1P39012 614 aa9.97□□□□□ -0.81
DDI1YER143W FYV10P40492 516 aa9.97□□□□□ -0.81
DDI1YER143W RTC4P53850 401 aa9.97□□□□□ -0.81
DDI1YER143W VMS1Q04311 632 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
DDI1YER143W SGD1Q06132 899 aa9.97□□□□□ -0.81
DDI1YER143W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
DDI1YER143W GSY2P27472 705 aa9.96□□□□□ -0.82
DDI1YER143W HIR1P32479 840 aa9.96□□□□□ -0.82
DDI1YER143W YGR273CP53329 174 aa9.96□□□□□ -0.82
DDI1YER143W ALD6P54115 500 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
DDI1YER143W SPH1Q06160 661 aa9.96□□□□□ -0.82
DDI1YER143W WHI4Q07655 649 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
DDI1YER143W GUD1Q07729 489 aa9.96□□□□□ -0.82
DDI1YER143W OXR1Q08952 273 aa9.96□□□□□ -0.82
DDI1YER143W TUF1P02992 437 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
DDI1YER143W HVG1P0CE11 249 aa9.95□□□□□ -0.82
DDI1YER143W SAM1P10659 382 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
DDI1YER143W VAB2P40003 282 aa9.95□□□□□ -0.82
DDI1YER143W NET1P47035 1189 aa9.95□□□□□ -0.82
DDI1YER143W ORC4P54791 529 aa9.95□□□□□ -0.82
DDI1YER143W FOB1O13329 566 aa9.94□□□□□ -0.82
DDI1YER143W TAF13P11747 167 aa9.94□□□□□ -0.82
DDI1YER143W PWP2P25635 923 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
DDI1YER143W MRPL10P36520 322 aa9.94□□□□□ -0.82
DDI1YER143W RRM3P38766 723 aa9.94□□□□□ -0.82
DDI1YER143W CTR1P49573 406 aa9.94□□□□□ -0.82
DDI1YER143W UBA2P52488 636 aa9.94□□□□□ -0.82
DDI1YER143W LIF1P53150 421 aa9.94□□□□□ -0.82
DDI1YER143W SDA1P53313 767 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
DDI1YER143W OYE2Q03558 400 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
DDI1YER143W BUL2Q03758 920 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
DDI1YER143W CSM3Q04659 317 aa9.94□□□□□ -0.82
DDI1YER143W ADY4Q05955 493 aa9.94□□□□□ -0.82
DDI1YER143W ARP6Q12509 438 aa9.94□□□□□ -0.82
DDI1YER143W YEL076C-AP0CX16 216 aa9.93□□□□□ -0.82
DDI1YER143W YLR464WP0CX17 216 aa9.93□□□□□ -0.82
DDI1YER143W ISW1P38144 1129 aa9.93□□□□□ -0.82
DDI1YER143W ERG7P38604 731 aa9.93□□□□□ -0.82
DDI1YER143W ORC6P38826 435 aa9.93□□□□□ -0.82
DDI1YER143W YEL076CP39971 216 aa9.93□□□□□ -0.82
DDI1YER143W BRE2P43132 505 aa9.93□□□□□ -0.82
DDI1YER143W MFM1Q02783 413 aa9.93□□□□□ -0.82
DDI1YER143W DUS3Q06053 668 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
DDI1YER143W CKA2P19454 339 aa9.92□□□□□ -0.82
DDI1YER143W ISY1P21374 235 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
DDI1YER143W GSY1P23337 708 aa9.92□□□□□ -0.82
DDI1YER143W CDC15P27636 974 aa9.92□□□□□ -0.82
DDI1YER143W UTR4P32626 227 aa9.92□□□□□ -0.82
DDI1YER143W SHP1P34223 423 aa9.92□□□□□ -0.82
DDI1YER143W MPE1P35728 441 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
DDI1YER143W PET10P36139 283 aa9.92□□□□□ -0.82
DDI1YER143W ROG3P43602 733 aa9.92□□□□□ -0.82
DDI1YER143W FUS2Q05670 677 aa9.92□□□□□ -0.82
DDI1YER143W PSR2Q07949 397 aa9.92□□□□□ -0.82
DDI1YER143W ILV1P00927 576 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
DDI1YER143W IXR1P33417 597 aa9.91□□□□□ -0.82
DDI1YER143W UBP11P36026 717 aa9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.8 ms