RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000030117.4

Smu1-201, Transcript of WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smu1, Length 2,418 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1-201ENSMUST00000030117 Becn1O88597 448 aa21.74■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mum1Q6DID5 682 aa21.74■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nol11Q8BJW5 723 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa21.74■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 HnrnpmQ9D0E1 729 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rcan3Q9JKK0 239 aa21.74■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kdm4aQ8BW72 1064 aa21.74■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dip2bQ3UH60 1574 aa21.73■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Atp6v1dP57746 247 aa21.73■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 St18Q80TY4 1045 aa21.73■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ripk4Q9ERK0 786 aa21.73■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Zscan25B2RX31 543 aa21.72■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pank2Q3U4S0 443 aa21.72■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tshz3Q8CGV9 1081 aa21.72■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 EvcP57680 1005 aa21.72■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Anapc15P60007 132 aa21.72■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Atp8b2P98199 1209 aa21.72■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 NgefQ8CHT1 710 aa21.72■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Q3TQI7 289 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Igsf1Q7TQA1 1317 aa21.71■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mknk2Q8CDB0 459 aa21.71■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 CemipQ8BI06 1361 aa21.71■■□□□ 1.07
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cpa2Q504N0 417 aa21.7■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cwc27Q3TKY6 469 aa21.7■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gse1Q3U3C9 1213 aa21.7■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 RictorQ6QI06 1708 aa21.7■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 FancaQ9JL70 1439 aa21.7■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccne1Q61457 408 aa21.69■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Sirt1Q923E4 737 aa21.69■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Slit2Q9R1B9 1521 aa21.69■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Znf335A2A5K6 1337 aa21.69■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Smarce1O54941 411 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ppp1r18Q8BQ30 594 aa21.68■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 E4f1Q8CCE9 783 aa21.68■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 NalcnQ8BXR5 1738 aa21.68■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pnma3Q8JZW8 466 aa21.68■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Stk36Q69ZM6 1316 aa21.67■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mcmdc2E9Q956 681 aa21.67■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Eya1P97767 591 aa21.67■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gzf1Q4VBD9 706 aa21.67■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 KinQ8K339 391 aa21.67■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Parp14Q2EMV9 1817 aa21.67■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Jakmip1Q8BVL9 626 aa21.67■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Noc3lQ8VI84 807 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pmfbp1Q9WVQ0 1022 aa21.66■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tpx2A2APB8 745 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Q3UJC8 639 aa21.65■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pdzrn3Q69ZS0 1063 aa21.65■■□□□ 1.06
Smu1-201ENSMUST00000030117 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccdc7Q9D541 371 aa21.64■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 N4bp2F8VQG7 1678 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Larp1bA0A0A6YXJ7 370 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ddx19aQ61655 478 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Chd1lQ9CXF7 900 aa21.63■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Disp3A3KFU9 1347 aa21.63■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Strn4P58404 760 aa21.63■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mindy4Q3UQI9 744 aa21.63■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Dennd6aQ8BH65 605 aa21.62■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ms4a2P20490 235 aa21.61■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Unc5clQ6R653 518 aa21.61■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cabp4Q8VHC5 271 aa21.61■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Slx4ipQ9D7Y9 413 aa21.61■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Slit3Q9WVB4 1523 aa21.61■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Elmsan1E9Q2I4 1089 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ubr1O70481 1757 aa21.61■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nol12Q8BG17 217 aa21.6■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Trpm3Q5F4S9 1721 aa21.6■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Atf5O70191 283 aa21.6■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Chpf2Q3UU43 768 aa21.6■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Olfml1Q8BSH2 233 aa21.59■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Camta1A2A891 1682 aa21.59■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pik3c2aQ61194 1686 aa21.59■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tnnt1O88346 262 aa21.59■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Hoxa7P02830 229 aa21.59■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa21.59■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccar2Q8VDP4 922 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nlgn1Q99K10 843 aa21.59■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nckap5lQ6GQX2 1323 aa21.59■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Anp32cQ64G17 123 aa21.58■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Mlh1Q9JK91 760 aa21.58■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Map2P20357 1828 aa21.58■■□□□ 1.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pnpla7A2AJ88 1352 aa21.58■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Sox12Q04890 314 aa21.58■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gm21190A0A0G2JGJ6 266 aa21.57■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ptpn23Q6PB44 1692 aa21.57■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Col16a1Q8BLX7 1580 aa21.57■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Myo5bP21271 1818 aa21.56■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rad50P70388 1312 aa21.56■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccdc173A0JLY1 547 aa21.56■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ier5O89113 308 aa21.56■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Irf5P56477 497 aa21.56■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Casc1Q6TDU8 730 aa21.56■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cyp2d11P24457 504 aa21.55■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 HypkQ9CR41 129 aa21.55■■□□□ 1.04
Smu1-201ENSMUST00000030117 Scaf1Q5U4C3 1256 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 84 ms