RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000030117.4

Smu1-201, Transcript of WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Smu1, Length 2,418 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1-201ENSMUST00000030117 NischQ80TM9 1593 aa33.39■■■□□ 2.94
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Smu1-201ENSMUST00000030117 Rhox8Q6VSS7 320 aa31.47■■■□□ 2.63
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rtl1Q7M732 1744 aa31.35■■■□□ 2.61
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccdc180J3QNE4 1664 aa30.91■■■□□ 2.54
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Smu1-201ENSMUST00000030117 HrcG5E8J6 738 aa29.41■■■□□ 2.3
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa29.3■■■□□ 2.28
Smu1-201ENSMUST00000030117 ScribQ80U72 1612 aa29.2■■■□□ 2.27
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa29.13■■■□□ 2.25
Smu1-201ENSMUST00000030117 Baz1aO88379 1555 aa28.97■■■□□ 2.23
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kdm5dQ62240 1548 aa28.79■■■□□ 2.2
Smu1-201ENSMUST00000030117 Trim41Q5NCC3 630 aa28.71■■■□□ 2.19
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pcgf6Q99NA9 353 aa28.53■■■□□ 2.16
Smu1-201ENSMUST00000030117 NacadQ5SWP3 1504 aa28.47■■■□□ 2.15
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cep164Q5DU05 1446 aa28.4■■■□□ 2.14
Smu1-201ENSMUST00000030117 Smarca2Q6DIC0 1577 aa28.36■■■□□ 2.13
Smu1-201ENSMUST00000030117 Crybg2B7ZCC2 1516 aa28.29■■■□□ 2.12
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Smu1-201ENSMUST00000030117 Chic1Q8CBW7 227 aa27.85■■■□□ 2.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Sycp2Q9CUU3 1500 aa27.84■■■□□ 2.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cngb1E1AZ71 1325 aa27.84■■■□□ 2.05
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gab3Q8BSM5 595 aa27.75■■■□□ 2.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa27.63■■■□□ 2.01
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Smu1-201ENSMUST00000030117 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa27.58■■■□□ 2.01
Smu1-201ENSMUST00000030117 NefmP08553 848 aa27.52■■■□□ 2
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Smu1-201ENSMUST00000030117 Mier1Q5UAK0 511 aa27.47■■□□□ 1.99
Smu1-201ENSMUST00000030117 Synj1Q8CHC4 1574 aa27.45■■□□□ 1.99
Smu1-201ENSMUST00000030117 Neurod1Q60867 357 aa27.4■■□□□ 1.98
Smu1-201ENSMUST00000030117 CftrP26361 1476 aa27.22■■□□□ 1.95
Smu1-201ENSMUST00000030117 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
Smu1-201ENSMUST00000030117 Top2bQ64511 1612 aa27.19■■□□□ 1.94
Smu1-201ENSMUST00000030117 BicraF8VPZ9 1578 aa27.16■■□□□ 1.94
Smu1-201ENSMUST00000030117 Sall2Q9QX96 1004 aa27.16■■□□□ 1.94
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa27.02■■□□□ 1.92
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa26.94■■□□□ 1.9
Smu1-201ENSMUST00000030117 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa26.93■■□□□ 1.9
Smu1-201ENSMUST00000030117 UbtfP25976 765 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
Smu1-201ENSMUST00000030117 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
Smu1-201ENSMUST00000030117 Fmn1Q05860 1466 aa26.76■■□□□ 1.88
Smu1-201ENSMUST00000030117 Anks4bQ8K3X6 423 aa26.75■■□□□ 1.87
Smu1-201ENSMUST00000030117 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
Smu1-201ENSMUST00000030117 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
Smu1-201ENSMUST00000030117 Wdr66E9Q743 1299 aa26.73■■□□□ 1.87
Smu1-201ENSMUST00000030117 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cep162Q6ZQ06 1403 aa26.7■■□□□ 1.87
Smu1-201ENSMUST00000030117 Myt1lP97500 1187 aa26.63■■□□□ 1.85
Smu1-201ENSMUST00000030117 ClspnQ80YR7 1315 aa26.59■■□□□ 1.85
Smu1-201ENSMUST00000030117 Csrnp3P59055 597 aa26.49■■□□□ 1.83
Smu1-201ENSMUST00000030117 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
Smu1-201ENSMUST00000030117 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa26.46■■□□□ 1.83
Smu1-201ENSMUST00000030117 Npm2Q80W85 207 aa26.45■■□□□ 1.82
Smu1-201ENSMUST00000030117 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
Smu1-201ENSMUST00000030117 TonslQ6NZL6 1363 aa26.44■■□□□ 1.82
Smu1-201ENSMUST00000030117 Clip1Q922J3 1391 aa26.4■■□□□ 1.82
Smu1-201ENSMUST00000030117 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa26.36■■□□□ 1.81
Smu1-201ENSMUST00000030117 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa26.34■■□□□ 1.81
Smu1-201ENSMUST00000030117 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa26.34■■□□□ 1.81
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa26.3■■□□□ 1.8
Smu1-201ENSMUST00000030117 TnnQ80Z71 1560 aa26.15■■□□□ 1.78
Smu1-201ENSMUST00000030117 Aplp2Q06335 707 aa26.14■■□□□ 1.78
Smu1-201ENSMUST00000030117 Arhgap35Q91YM2 1499 aa26.12■■□□□ 1.77
Smu1-201ENSMUST00000030117 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
Smu1-201ENSMUST00000030117 Arap1Q4LDD4 1452 aa26.03■■□□□ 1.76
Smu1-201ENSMUST00000030117 Eea1Q8BL66 1411 aa26.02■■□□□ 1.76
Smu1-201ENSMUST00000030117 PtprkP35822 1457 aa26■■□□□ 1.75
Smu1-201ENSMUST00000030117 NrkQ9R0G8 1455 aa26■■□□□ 1.75
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kdm5bQ80Y84 1544 aa25.95■■□□□ 1.74
Smu1-201ENSMUST00000030117 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa25.92■■□□□ 1.74
Smu1-201ENSMUST00000030117 CenpbP27790 599 aa25.9■■□□□ 1.74
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa25.9■■□□□ 1.74
Smu1-201ENSMUST00000030117 Ccdc18Q640L5 1455 aa25.9■■□□□ 1.74
Smu1-201ENSMUST00000030117 Setd5Q5XJV7 1441 aa25.87■■□□□ 1.73
Smu1-201ENSMUST00000030117 Eid3Q3V124 375 aa25.87■■□□□ 1.73
Smu1-201ENSMUST00000030117 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
Smu1-201ENSMUST00000030117 Shroom4Q1W617 1475 aa25.81■■□□□ 1.72
Smu1-201ENSMUST00000030117 Lamc3Q9R0B6 1581 aa25.81■■□□□ 1.72
Smu1-201ENSMUST00000030117 Map3k1P53349 1493 aa25.8■■□□□ 1.72
Smu1-201ENSMUST00000030117 Gm38655A0A286YDK6 273 aa25.78■■□□□ 1.72
Smu1-201ENSMUST00000030117 Il27Q8K3I6 234 aa25.77■■□□□ 1.72
Smu1-201ENSMUST00000030117 Frmpd1A2AKB4 1549 aa25.76■■□□□ 1.71
Smu1-201ENSMUST00000030117 Tiam1Q60610 1591 aa25.75■■□□□ 1.71
Smu1-201ENSMUST00000030117 TchhA0A0B4J1F9 1599 aa25.74■■□□□ 1.71
Smu1-201ENSMUST00000030117 Baz1bQ9Z277 1479 aa25.72■■□□□ 1.71
Smu1-201ENSMUST00000030117 Wdr62Q3U3T8 1523 aa25.72■■□□□ 1.71
Smu1-201ENSMUST00000030117 Camsap1A2AHC3 1581 aa25.7■■□□□ 1.71
Smu1-201ENSMUST00000030117 Kif15Q6P9L6 1387 aa25.7■■□□□ 1.7
Smu1-201ENSMUST00000030117 Myt1Q8CFC2 1127 aa25.67■■□□□ 1.7
Smu1-201ENSMUST00000030117 Naip1Q9QWK5 1403 aa25.65■■□□□ 1.7
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