Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Mindy4Q3UQI9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Mindy4Q3UQI9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
Mindy4Q3UQI9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Mindy4Q3UQI9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Mindy4Q3UQI9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Mindy4Q3UQI9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Mindy4Q3UQI9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Mindy4Q3UQI9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Mindy4Q3UQI9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Mindy4Q3UQI9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Mindy4Q3UQI9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Mindy4Q3UQI9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.14
Mindy4Q3UQI9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Mindy4Q3UQI9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Mindy4Q3UQI9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Mindy4Q3UQI9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Mindy4Q3UQI9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Mindy4Q3UQI9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Mindy4Q3UQI9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Mindy4Q3UQI9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
Mindy4Q3UQI9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Mindy4Q3UQI9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Mindy4Q3UQI9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Mindy4Q3UQI9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Mindy4Q3UQI9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Mindy4Q3UQI9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Mindy4Q3UQI9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Mindy4Q3UQI9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Mindy4Q3UQI9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Mindy4Q3UQI9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Mindy4Q3UQI9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Mindy4Q3UQI9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Mindy4Q3UQI9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Mindy4Q3UQI9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Mindy4Q3UQI9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Mindy4Q3UQI9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Mindy4Q3UQI9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Mindy4Q3UQI9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Mindy4Q3UQI9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Mindy4Q3UQI9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Mindy4Q3UQI9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Mindy4Q3UQI9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Mindy4Q3UQI9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Mindy4Q3UQI9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Mindy4Q3UQI9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Mindy4Q3UQI9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Mindy4Q3UQI9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Mindy4Q3UQI9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Mindy4Q3UQI9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Mindy4Q3UQI9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Mindy4Q3UQI9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Mindy4Q3UQI9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Mindy4Q3UQI9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Mindy4Q3UQI9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Mindy4Q3UQI9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Mindy4Q3UQI9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Mindy4Q3UQI9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Mindy4Q3UQI9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Mindy4Q3UQI9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Mindy4Q3UQI9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Mindy4Q3UQI9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Mindy4Q3UQI9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Mindy4Q3UQI9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Mindy4Q3UQI9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Mindy4Q3UQI9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Mindy4Q3UQI9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Mindy4Q3UQI9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Mindy4Q3UQI9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Mindy4Q3UQI9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Mindy4Q3UQI9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Mindy4Q3UQI9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Mindy4Q3UQI9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Mindy4Q3UQI9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Mindy4Q3UQI9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Mindy4Q3UQI9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Mindy4Q3UQI9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Mindy4Q3UQI9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Mindy4Q3UQI9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Mindy4Q3UQI9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Mindy4Q3UQI9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Mindy4Q3UQI9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Mindy4Q3UQI9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Mindy4Q3UQI9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Mindy4Q3UQI9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Mindy4Q3UQI9 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Mindy4Q3UQI9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Mindy4Q3UQI9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Mindy4Q3UQI9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Mindy4Q3UQI9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Mindy4Q3UQI9 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Mindy4Q3UQI9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Mindy4Q3UQI9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Mindy4Q3UQI9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Mindy4Q3UQI9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Mindy4Q3UQI9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Mindy4Q3UQI9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Mindy4Q3UQI9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
Mindy4Q3UQI9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Mindy4Q3UQI9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms