Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,49■■■■□ 3,91
Rcan3Q9JKK0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,01■■■■□ 3,68
Rcan3Q9JKK0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,84■■■■□ 3,65
Rcan3Q9JKK0 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,34■■■■□ 3,57
Rcan3Q9JKK0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC37,2■■■■□ 3,55
Rcan3Q9JKK0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,99■■■■□ 3,51
Rcan3Q9JKK0 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Rcan3Q9JKK0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Rcan3Q9JKK0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,74■■■■□ 3,31
Rcan3Q9JKK0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Rcan3Q9JKK0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Rcan3Q9JKK0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Rcan3Q9JKK0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Rcan3Q9JKK0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Rcan3Q9JKK0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Rcan3Q9JKK0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,89■■■■□ 3,18
Rcan3Q9JKK0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC34,71■■■■□ 3,15
Rcan3Q9JKK0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34,48■■■■□ 3,11
Rcan3Q9JKK0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34,43■■■■□ 3,1
Rcan3Q9JKK0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,19■■■■□ 3,06
Rcan3Q9JKK0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,18■■■■□ 3,06
Rcan3Q9JKK0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,95■■■■□ 3,03
Rcan3Q9JKK0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,9■■■■□ 3,02
Rcan3Q9JKK0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,88■■■■□ 3,01
Rcan3Q9JKK0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,77■■■■□ 3
Rcan3Q9JKK0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC33,74■■■□□ 2,99
Rcan3Q9JKK0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC33,68■■■□□ 2,98
Rcan3Q9JKK0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33,59■■■□□ 2,97
Rcan3Q9JKK0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
Rcan3Q9JKK0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33,52■■■□□ 2,96
Rcan3Q9JKK0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,51■■■□□ 2,95
Rcan3Q9JKK0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC33,47■■■□□ 2,95
Rcan3Q9JKK0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,39■■■□□ 2,94
Rcan3Q9JKK0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,37■■■□□ 2,93
Rcan3Q9JKK0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Rcan3Q9JKK0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
Rcan3Q9JKK0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33,24■■■□□ 2,91
Rcan3Q9JKK0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33,23■■■□□ 2,91
Rcan3Q9JKK0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC33,22■■■□□ 2,91
Rcan3Q9JKK0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,2■■■□□ 2,91
Rcan3Q9JKK0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33,2■■■□□ 2,9
Rcan3Q9JKK0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Rcan3Q9JKK0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Rcan3Q9JKK0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,09■■■□□ 2,89
Rcan3Q9JKK0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Rcan3Q9JKK0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Rcan3Q9JKK0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Rcan3Q9JKK0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Rcan3Q9JKK0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Rcan3Q9JKK0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Rcan3Q9JKK0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Rcan3Q9JKK0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32,62■■■□□ 2,81
Rcan3Q9JKK0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,52■■■□□ 2,8
Rcan3Q9JKK0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,8
Rcan3Q9JKK0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,51■■■□□ 2,79
Rcan3Q9JKK0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,4■■■□□ 2,78
Rcan3Q9JKK0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
Rcan3Q9JKK0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,24■■■□□ 2,75
Rcan3Q9JKK0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
Rcan3Q9JKK0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
Rcan3Q9JKK0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,2■■■□□ 2,75
Rcan3Q9JKK0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32,2■■■□□ 2,75
Rcan3Q9JKK0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
Rcan3Q9JKK0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
Rcan3Q9JKK0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
Rcan3Q9JKK0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Rcan3Q9JKK0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
Rcan3Q9JKK0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32,03■■■□□ 2,72
Rcan3Q9JKK0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,97■■■□□ 2,71
Rcan3Q9JKK0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC31,9■■■□□ 2,7
Rcan3Q9JKK0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC31,88■■■□□ 2,69
Rcan3Q9JKK0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,8■■■□□ 2,68
Rcan3Q9JKK0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,77■■■□□ 2,68
Rcan3Q9JKK0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Rcan3Q9JKK0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC31,72■■■□□ 2,67
Rcan3Q9JKK0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,66■■■□□ 2,66
Rcan3Q9JKK0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Rcan3Q9JKK0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,6■■■□□ 2,65
Rcan3Q9JKK0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Rcan3Q9JKK0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31,51■■■□□ 2,63
Rcan3Q9JKK0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31,48■■■□□ 2,63
Rcan3Q9JKK0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,47■■■□□ 2,63
Rcan3Q9JKK0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,46■■■□□ 2,63
Rcan3Q9JKK0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Rcan3Q9JKK0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,45■■■□□ 2,63
Rcan3Q9JKK0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Rcan3Q9JKK0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Rcan3Q9JKK0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,43■■■□□ 2,62
Rcan3Q9JKK0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC31,42■■■□□ 2,62
Rcan3Q9JKK0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31,37■■■□□ 2,61
Rcan3Q9JKK0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Rcan3Q9JKK0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,33■■■□□ 2,61
Rcan3Q9JKK0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,27■■■□□ 2,6
Rcan3Q9JKK0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31,21■■■□□ 2,59
Rcan3Q9JKK0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,14■■■□□ 2,58
Rcan3Q9JKK0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31,14■■■□□ 2,58
Rcan3Q9JKK0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,11■■■□□ 2,57
Rcan3Q9JKK0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Rcan3Q9JKK0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Rcan3Q9JKK0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10 ms