Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
VPS25Q9BRG1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS25Q9BRG1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS25Q9BRG1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS25Q9BRG1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
VPS25Q9BRG1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS25Q9BRG1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VPS25Q9BRG1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VPS25Q9BRG1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VPS25Q9BRG1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VPS25Q9BRG1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
VPS25Q9BRG1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VPS25Q9BRG1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VPS25Q9BRG1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VPS25Q9BRG1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VPS25Q9BRG1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VPS25Q9BRG1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VPS25Q9BRG1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS25Q9BRG1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS25Q9BRG1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS25Q9BRG1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VPS25Q9BRG1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VPS25Q9BRG1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VPS25Q9BRG1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VPS25Q9BRG1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VPS25Q9BRG1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VPS25Q9BRG1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VPS25Q9BRG1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VPS25Q9BRG1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS25Q9BRG1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS25Q9BRG1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS25Q9BRG1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS25Q9BRG1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VPS25Q9BRG1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VPS25Q9BRG1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VPS25Q9BRG1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VPS25Q9BRG1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS25Q9BRG1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VPS25Q9BRG1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VPS25Q9BRG1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS25Q9BRG1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VPS25Q9BRG1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VPS25Q9BRG1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VPS25Q9BRG1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
VPS25Q9BRG1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS25Q9BRG1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS25Q9BRG1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VPS25Q9BRG1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VPS25Q9BRG1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VPS25Q9BRG1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VPS25Q9BRG1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VPS25Q9BRG1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VPS25Q9BRG1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VPS25Q9BRG1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VPS25Q9BRG1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VPS25Q9BRG1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS25Q9BRG1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS25Q9BRG1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
VPS25Q9BRG1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VPS25Q9BRG1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VPS25Q9BRG1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS25Q9BRG1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS25Q9BRG1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS25Q9BRG1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS25Q9BRG1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
VPS25Q9BRG1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
VPS25Q9BRG1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VPS25Q9BRG1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS25Q9BRG1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VPS25Q9BRG1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
VPS25Q9BRG1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VPS25Q9BRG1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS25Q9BRG1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VPS25Q9BRG1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VPS25Q9BRG1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VPS25Q9BRG1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VPS25Q9BRG1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VPS25Q9BRG1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
VPS25Q9BRG1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
VPS25Q9BRG1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS25Q9BRG1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VPS25Q9BRG1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VPS25Q9BRG1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS25Q9BRG1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VPS25Q9BRG1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VPS25Q9BRG1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VPS25Q9BRG1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VPS25Q9BRG1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS25Q9BRG1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VPS25Q9BRG1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VPS25Q9BRG1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
VPS25Q9BRG1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS25Q9BRG1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VPS25Q9BRG1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VPS25Q9BRG1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VPS25Q9BRG1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VPS25Q9BRG1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VPS25Q9BRG1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VPS25Q9BRG1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VPS25Q9BRG1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms