Protein–RNA interactions for Protein: Q3E7B9

YOR008C-A, Uncharacterized protein YOR008C-A, yeastyeast

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOR008C-AQ3E7B9 NSR1YGR159C 1245 nt14.82□□□□□ -0.04
YOR008C-AQ3E7B9 YML009W-BYML009W-B 477 nt14.46□□□□□ -0.09
YOR008C-AQ3E7B9 NOP1YDL014W 984 nt13.98□□□□□ -0.17
YOR008C-AQ3E7B9 MDJ1YFL016C 1536 nt13.47□□□□□ -0.25
YOR008C-AQ3E7B9 YJL027CYJL027C 417 nt12.47□□□□□ -0.41
YOR008C-AQ3E7B9 YKL036CYKL036C 393 nt12.43□□□□□ -0.42
YOR008C-AQ3E7B9 SRX1YKL086W 384 nt12.16□□□□□ -0.46
YOR008C-AQ3E7B9 Q0297Q0297 156 nt12.04□□□□□ -0.48
YOR008C-AQ3E7B9 DBP2YNL112W 1641 nt11.73□□□□□ -0.53
YOR008C-AQ3E7B9 YBR190WYBR190W 312 nt11.69□□□□□ -0.54
YOR008C-AQ3E7B9 YCR051WYCR051W 669 nt11.48□□□□□ -0.57
YOR008C-AQ3E7B9 RTC3YHR087W 336 nt11.38□□□□□ -0.59
YOR008C-AQ3E7B9 SSA3YBL075C 1950 nt11.23□□□□□ -0.61
YOR008C-AQ3E7B9 TRN1tP(UGG)A 72 nt11.22□□□□□ -0.61
YOR008C-AQ3E7B9 SUF9tP(UGG)F 72 nt11.22□□□□□ -0.61
YOR008C-AQ3E7B9 SUF8tP(UGG)H 72 nt11.22□□□□□ -0.61
YOR008C-AQ3E7B9 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt11.22□□□□□ -0.61
YOR008C-AQ3E7B9 SUF7tP(UGG)M 72 nt11.22□□□□□ -0.61
YOR008C-AQ3E7B9 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt11.22□□□□□ -0.61
YOR008C-AQ3E7B9 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt11.22□□□□□ -0.61
YOR008C-AQ3E7B9 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt11.22□□□□□ -0.61
YOR008C-AQ3E7B9 SUF11tP(UGG)O2 72 nt11.22□□□□□ -0.61
YOR008C-AQ3E7B9 CCC1YLR220W 969 nt11.09□□□□□ -0.63
YOR008C-AQ3E7B9 RVS167YDR388W 1449 nt11.05□□□□□ -0.64
YOR008C-AQ3E7B9 SCS3YGL126W 1143 nt11.03□□□□□ -0.64
YOR008C-AQ3E7B9 PUT4YOR348C 1884 nt10.89□□□□□ -0.67
YOR008C-AQ3E7B9 RPP1BYDL130W 321 nt10.8□□□□□ -0.68
YOR008C-AQ3E7B9 SCJ1YMR214W 1134 nt10.76□□□□□ -0.69
YOR008C-AQ3E7B9 YOL085CYOL085C 342 nt10.75□□□□□ -0.69
YOR008C-AQ3E7B9 PKP1YIL042C 1185 nt10.59□□□□□ -0.71
YOR008C-AQ3E7B9 ARE1YCR048W 1833 nt10.55□□□□□ -0.72
YOR008C-AQ3E7B9 SHR5YOL110W 714 nt10.53□□□□□ -0.72
YOR008C-AQ3E7B9 POA1YBR022W 534 nt10.51□□□□□ -0.73
YOR008C-AQ3E7B9 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt10.48□□□□□ -0.73
YOR008C-AQ3E7B9 URN1YPR152C 1398 nt10.47□□□□□ -0.73
YOR008C-AQ3E7B9 SAH1YER043C 1350 nt10.44□□□□□ -0.74
YOR008C-AQ3E7B9 OPI9YLR338W 858 nt10.43□□□□□ -0.74
YOR008C-AQ3E7B9 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt10.42□□□□□ -0.74
YOR008C-AQ3E7B9 BSC6YOL137W 1494 nt10.36□□□□□ -0.75
YOR008C-AQ3E7B9 PET122YER153C 765 nt10.32□□□□□ -0.76
YOR008C-AQ3E7B9 RPN10YHR200W 807 nt10.3□□□□□ -0.76
YOR008C-AQ3E7B9 DEP1YAL013W 1218 nt10.3□□□□□ -0.76
YOR008C-AQ3E7B9 YDJ1YNL064C 1230 nt10.19□□□□□ -0.78
YOR008C-AQ3E7B9 SPT5YML010W 3192 nt10.18□□□□□ -0.78
YOR008C-AQ3E7B9 YNL208WYNL208W 600 nt10.18□□□□□ -0.78
YOR008C-AQ3E7B9 SCR1SCR1 522 nt10.18□□□□□ -0.78
YOR008C-AQ3E7B9 PUN1YLR414C 792 nt10.16□□□□□ -0.78
YOR008C-AQ3E7B9 BUD23YCR047C 828 nt10.15□□□□□ -0.78
YOR008C-AQ3E7B9 PTC2YER089C 1395 nt10.06□□□□□ -0.8
YOR008C-AQ3E7B9 SSA4YER103W 1929 nt10.06□□□□□ -0.8
YOR008C-AQ3E7B9 NAB2YGL122C 1578 nt10.03□□□□□ -0.8
YOR008C-AQ3E7B9 YJR018WYJR018W 363 nt9.99□□□□□ -0.81
YOR008C-AQ3E7B9 RRN5YLR141W 1092 nt9.99□□□□□ -0.81
YOR008C-AQ3E7B9 GAR1YHR089C 618 nt9.97□□□□□ -0.81
YOR008C-AQ3E7B9 DAL1YIR027C 1383 nt9.8□□□□□ -0.84
YOR008C-AQ3E7B9 YER088W-BYER088W-B 147 nt9.8□□□□□ -0.84
YOR008C-AQ3E7B9 MEP2YNL142W 1500 nt9.8□□□□□ -0.84
YOR008C-AQ3E7B9 FIS1YIL065C 468 nt9.77□□□□□ -0.85
YOR008C-AQ3E7B9 ATS1YAL020C 1002 nt9.77□□□□□ -0.85
YOR008C-AQ3E7B9 INM2YDR287W 879 nt9.74□□□□□ -0.85
YOR008C-AQ3E7B9 FPR4YLR449W 1179 nt9.74□□□□□ -0.85
YOR008C-AQ3E7B9 RPP2BYDR382W 333 nt9.72□□□□□ -0.85
YOR008C-AQ3E7B9 BDF1YLR399C 2061 nt9.7□□□□□ -0.86
YOR008C-AQ3E7B9 TIR1YER011W 765 nt9.68□□□□□ -0.86
YOR008C-AQ3E7B9 PHO4YFR034C 939 nt9.68□□□□□ -0.86
YOR008C-AQ3E7B9 RSB1YOR049C 1065 nt9.67□□□□□ -0.86
YOR008C-AQ3E7B9 YPS1YLR120C 1710 nt9.65□□□□□ -0.86
YOR008C-AQ3E7B9 YJR120WYJR120W 351 nt9.65□□□□□ -0.86
YOR008C-AQ3E7B9 SSA1YAL005C 1929 nt9.6□□□□□ -0.87
YOR008C-AQ3E7B9 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.59□□□□□ -0.87
YOR008C-AQ3E7B9 TAT1YBR069C 1860 nt9.57□□□□□ -0.88
YOR008C-AQ3E7B9 DCW1YKL046C 1350 nt9.57□□□□□ -0.88
YOR008C-AQ3E7B9 YMR090WYMR090W 684 nt9.56□□□□□ -0.88
YOR008C-AQ3E7B9 YDR095CYDR095C 411 nt9.53□□□□□ -0.88
YOR008C-AQ3E7B9 YBL100CYBL100C 315 nt9.52□□□□□ -0.89
YOR008C-AQ3E7B9 EMI2YDR516C 1503 nt9.49□□□□□ -0.89
YOR008C-AQ3E7B9 YJL225CYJL225C 5277 nt9.45□□□□□ -0.9
YOR008C-AQ3E7B9 YBR220CYBR220C 1683 nt9.45□□□□□ -0.9
YOR008C-AQ3E7B9 BDH2YAL061W 1254 nt9.41□□□□□ -0.9
YOR008C-AQ3E7B9 FUN26YAL022C 1554 nt9.39□□□□□ -0.91
YOR008C-AQ3E7B9 YDL221WYDL221W 552 nt9.39□□□□□ -0.91
YOR008C-AQ3E7B9 ALF1YNL148C 765 nt9.39□□□□□ -0.91
YOR008C-AQ3E7B9 RPP2AYOL039W 321 nt9.37□□□□□ -0.91
YOR008C-AQ3E7B9 SDH1YKL148C 1923 nt9.36□□□□□ -0.91
YOR008C-AQ3E7B9 TRM9YML014W 840 nt9.33□□□□□ -0.92
YOR008C-AQ3E7B9 PTP1YDL230W 1008 nt9.31□□□□□ -0.92
YOR008C-AQ3E7B9 CAC2YML102W 1407 nt9.31□□□□□ -0.92
YOR008C-AQ3E7B9 SRB2YHR041C 633 nt9.28□□□□□ -0.92
YOR008C-AQ3E7B9 SEC11YIR022W 504 nt9.26□□□□□ -0.93
YOR008C-AQ3E7B9 PAC11YDR488C 1602 nt9.24□□□□□ -0.93
YOR008C-AQ3E7B9 SCC4YER147C 1875 nt9.24□□□□□ -0.93
YOR008C-AQ3E7B9 SUF2tP(AGG)C 72 nt9.24□□□□□ -0.93
YOR008C-AQ3E7B9 SUF10tP(AGG)N 72 nt9.24□□□□□ -0.93
YOR008C-AQ3E7B9 LSM3YLR438C-A 270 nt9.24□□□□□ -0.93
YOR008C-AQ3E7B9 CCT6YDR188W 1641 nt9.23□□□□□ -0.93
YOR008C-AQ3E7B9 SIS1YNL007C 1059 nt9.22□□□□□ -0.93
YOR008C-AQ3E7B9 PCH2YBR186W 1695 nt9.22□□□□□ -0.93
YOR008C-AQ3E7B9 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.2□□□□□ -0.94
YOR008C-AQ3E7B9 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.2□□□□□ -0.94
YOR008C-AQ3E7B9 IRC15YPL017C 1500 nt9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 79 ms