Protein–RNA interactions for Protein: P38834

YHR130C, Uncharacterized protein YHR130C, yeastyeast

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR130CP38834 NSR1YGR159C 1245 nt13.81□□□□□ -0.2
YHR130CP38834 YML009W-BYML009W-B 477 nt13.31□□□□□ -0.28
YHR130CP38834 NOP1YDL014W 984 nt12.81□□□□□ -0.36
YHR130CP38834 MDJ1YFL016C 1536 nt12.69□□□□□ -0.38
YHR130CP38834 SSA3YBL075C 1950 nt12.29□□□□□ -0.44
YHR130CP38834 YJL027CYJL027C 417 nt11.75□□□□□ -0.53
YHR130CP38834 YKL036CYKL036C 393 nt11.22□□□□□ -0.61
YHR130CP38834 SRX1YKL086W 384 nt11.13□□□□□ -0.63
YHR130CP38834 YBR190WYBR190W 312 nt11.08□□□□□ -0.64
YHR130CP38834 DBP2YNL112W 1641 nt10.98□□□□□ -0.65
YHR130CP38834 Q0297Q0297 156 nt10.97□□□□□ -0.65
YHR130CP38834 RTC3YHR087W 336 nt10.76□□□□□ -0.69
YHR130CP38834 YCR051WYCR051W 669 nt10.48□□□□□ -0.73
YHR130CP38834 PAC11YDR488C 1602 nt10.47□□□□□ -0.73
YHR130CP38834 NVJ2YPR091C 2313 nt10.45□□□□□ -0.74
YHR130CP38834 PUT4YOR348C 1884 nt10.43□□□□□ -0.74
YHR130CP38834 TRN1tP(UGG)A 72 nt10.39□□□□□ -0.75
YHR130CP38834 SUF9tP(UGG)F 72 nt10.39□□□□□ -0.75
YHR130CP38834 SUF8tP(UGG)H 72 nt10.39□□□□□ -0.75
YHR130CP38834 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt10.39□□□□□ -0.75
YHR130CP38834 SUF7tP(UGG)M 72 nt10.39□□□□□ -0.75
YHR130CP38834 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt10.39□□□□□ -0.75
YHR130CP38834 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt10.39□□□□□ -0.75
YHR130CP38834 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt10.39□□□□□ -0.75
YHR130CP38834 SUF11tP(UGG)O2 72 nt10.39□□□□□ -0.75
YHR130CP38834 RVS167YDR388W 1449 nt10.34□□□□□ -0.75
YHR130CP38834 SSA4YER103W 1929 nt10.31□□□□□ -0.76
YHR130CP38834 FPS1YLL043W 2010 nt10.29□□□□□ -0.76
YHR130CP38834 CCC1YLR220W 969 nt10.22□□□□□ -0.77
YHR130CP38834 SPT5YML010W 3192 nt10.11□□□□□ -0.79
YHR130CP38834 BDF1YLR399C 2061 nt10.08□□□□□ -0.8
YHR130CP38834 POA1YBR022W 534 nt10.05□□□□□ -0.8
YHR130CP38834 SSA1YAL005C 1929 nt10.05□□□□□ -0.8
YHR130CP38834 ARE1YCR048W 1833 nt10.05□□□□□ -0.8
YHR130CP38834 SCJ1YMR214W 1134 nt10.02□□□□□ -0.81
YHR130CP38834 BSC6YOL137W 1494 nt9.96□□□□□ -0.82
YHR130CP38834 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt9.95□□□□□ -0.82
YHR130CP38834 TAT1YBR069C 1860 nt9.93□□□□□ -0.82
YHR130CP38834 SAH1YER043C 1350 nt9.88□□□□□ -0.83
YHR130CP38834 OPI9YLR338W 858 nt9.85□□□□□ -0.83
YHR130CP38834 URN1YPR152C 1398 nt9.85□□□□□ -0.83
YHR130CP38834 SCS3YGL126W 1143 nt9.84□□□□□ -0.83
YHR130CP38834 RPP1BYDL130W 321 nt9.83□□□□□ -0.84
YHR130CP38834 SHR5YOL110W 714 nt9.8□□□□□ -0.84
YHR130CP38834 YJL225CYJL225C 5277 nt9.69□□□□□ -0.86
YHR130CP38834 YOL085CYOL085C 342 nt9.69□□□□□ -0.86
YHR130CP38834 RPN10YHR200W 807 nt9.68□□□□□ -0.86
YHR130CP38834 BUD23YCR047C 828 nt9.67□□□□□ -0.86
YHR130CP38834 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.66□□□□□ -0.86
YHR130CP38834 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.66□□□□□ -0.86
YHR130CP38834 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt9.63□□□□□ -0.87
YHR130CP38834 UME6YDR207C 2511 nt9.62□□□□□ -0.87
YHR130CP38834 DEP1YAL013W 1218 nt9.61□□□□□ -0.87
YHR130CP38834 PUN1YLR414C 792 nt9.61□□□□□ -0.87
YHR130CP38834 PKP1YIL042C 1185 nt9.54□□□□□ -0.88
YHR130CP38834 PTC2YER089C 1395 nt9.51□□□□□ -0.89
YHR130CP38834 NAB2YGL122C 1578 nt9.51□□□□□ -0.89
YHR130CP38834 YNL208WYNL208W 600 nt9.51□□□□□ -0.89
YHR130CP38834 MEP2YNL142W 1500 nt9.43□□□□□ -0.9
YHR130CP38834 PET122YER153C 765 nt9.41□□□□□ -0.9
YHR130CP38834 YJR018WYJR018W 363 nt9.37□□□□□ -0.91
YHR130CP38834 YDJ1YNL064C 1230 nt9.37□□□□□ -0.91
YHR130CP38834 DAL1YIR027C 1383 nt9.27□□□□□ -0.93
YHR130CP38834 FIS1YIL065C 468 nt9.26□□□□□ -0.93
YHR130CP38834 SCR1SCR1 522 nt9.25□□□□□ -0.93
YHR130CP38834 YMR090WYMR090W 684 nt9.22□□□□□ -0.93
YHR130CP38834 GAR1YHR089C 618 nt9.19□□□□□ -0.94
YHR130CP38834 FPR4YLR449W 1179 nt9.19□□□□□ -0.94
YHR130CP38834 DCW1YKL046C 1350 nt9.19□□□□□ -0.94
YHR130CP38834 YPS1YLR120C 1710 nt9.18□□□□□ -0.94
YHR130CP38834 INM2YDR287W 879 nt9.17□□□□□ -0.94
YHR130CP38834 GUT2YIL155C 1950 nt9.17□□□□□ -0.94
YHR130CP38834 PHO4YFR034C 939 nt9.16□□□□□ -0.94
YHR130CP38834 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt9.14□□□□□ -0.95
YHR130CP38834 YBR220CYBR220C 1683 nt9.13□□□□□ -0.95
YHR130CP38834 EMI2YDR516C 1503 nt9.12□□□□□ -0.95
YHR130CP38834 BOR1YNL275W 1731 nt9.12□□□□□ -0.95
YHR130CP38834 RPP2BYDR382W 333 nt9.1□□□□□ -0.95
YHR130CP38834 PCH2YBR186W 1695 nt9.1□□□□□ -0.95
YHR130CP38834 MCH5YOR306C 1566 nt9.09□□□□□ -0.95
YHR130CP38834 RRN5YLR141W 1092 nt9.08□□□□□ -0.96
YHR130CP38834 YDR095CYDR095C 411 nt9.06□□□□□ -0.96
YHR130CP38834 YDL221WYDL221W 552 nt9.02□□□□□ -0.97
YHR130CP38834 SEC11YIR022W 504 nt9.01□□□□□ -0.97
YHR130CP38834 YJR120WYJR120W 351 nt9.01□□□□□ -0.97
YHR130CP38834 SDH1YKL148C 1923 nt9□□□□□ -0.97
YHR130CP38834 YBL100CYBL100C 315 nt8.94□□□□□ -0.98
YHR130CP38834 TIR1YER011W 765 nt8.93□□□□□ -0.98
YHR130CP38834 PIB2YGL023C 1908 nt8.91□□□□□ -0.98
YHR130CP38834 YER088W-BYER088W-B 147 nt8.9□□□□□ -0.98
YHR130CP38834 RPP2AYOL039W 321 nt8.9□□□□□ -0.98
YHR130CP38834 SCC4YER147C 1875 nt8.87□□□□□ -0.99
YHR130CP38834 CAC2YML102W 1407 nt8.86□□□□□ -0.99
YHR130CP38834 PTP1YDL230W 1008 nt8.85□□□□□ -0.99
YHR130CP38834 ALF1YNL148C 765 nt8.85□□□□□ -0.99
YHR130CP38834 ALG12YNR030W 1656 nt8.81□□□□□ -1
YHR130CP38834 RPM1RPM1 483 nt8.81□□□□□ -1
YHR130CP38834 FUN26YAL022C 1554 nt8.8□□□□□ -1
YHR130CP38834 BDH2YAL061W 1254 nt8.76□□□□□ -1.01
YHR130CP38834 RSB1YOR049C 1065 nt8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.6 ms