Protein–RNA interactions for Protein: O15371

EIF3D, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3DO15371 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.192e-33■■■■■ 247.4
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EIF3DO15371 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.081e-20■■■■■ 66.6
EIF3DO15371 C12orf57-202ENST00000537087 662 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.511e-20■■■■■ 66.6
EIF3DO15371 C12orf57-207ENST00000545581 556 ntTSL 310.09□□□□□ -0.791e-20■■■■■ 66.6
EIF3DO15371 C12orf57-205ENST00000542222 640 ntTSL 29.9□□□□□ -0.821e-20■■■■■ 66.6
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EIF3DO15371 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 220.01■□□□□ 0.792e-16■■■■■ 56.2
EIF3DO15371 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.632e-16■■■■■ 56.2
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EIF3DO15371 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.22e-16■■■■■ 56.2
EIF3DO15371 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.632e-16■■■■■ 56.2
EIF3DO15371 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 59.94□□□□□ -0.822e-16■■■■■ 56.2
EIF3DO15371 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 39.94□□□□□ -0.822e-16■■■■■ 56.2
EIF3DO15371 SMC4-212ENST00000470240 724 ntTSL 38.76□□□□□ -1.012e-16■■■■■ 56.2
EIF3DO15371 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 43.96□□□□□ -1.782e-16■■■■■ 56.2
EIF3DO15371 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 53.91□□□□□ -1.782e-16■■■■■ 56.2
EIF3DO15371 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 53.53□□□□□ -1.842e-16■■■■■ 56.2
EIF3DO15371 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.22e-16■■■■■ 56.2
EIF3DO15371 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.382e-10■■■■■ 36.2
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EIF3DO15371 FAM193A-202ENST00000382839 4710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.432e-10■■■■■ 36.2
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EIF3DO15371 FAM193A-210ENST00000545951 3987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.862e-10■■■■■ 36.2
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EIF3DO15371 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.841e-9■■■■■ 33.4
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EIF3DO15371 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.373e-9■■■■■ 32.6
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EIF3DO15371 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.583e-9■■■■■ 32.6
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EIF3DO15371 TXNDC17-206ENST00000574429 2100 nt16.78■□□□□ 0.283e-9■■■■■ 32.4
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EIF3DO15371 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.033e-9■■■■■ 32.4
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EIF3DO15371 HHAT-203ENST00000367010 3626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.924e-8■■■■■ 27.1
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