Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms