Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
UTP11Q9Y3A2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
UTP11Q9Y3A2 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms