Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCDHA12Q9UN75 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms