Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI40

SLC24A2, Sodium/potassium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A2Q9UI40 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SLC24A2Q9UI40 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC24A2Q9UI40 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC24A2Q9UI40 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC24A2Q9UI40 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC24A2Q9UI40 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC24A2Q9UI40 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC24A2Q9UI40 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC24A2Q9UI40 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC24A2Q9UI40 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC24A2Q9UI40 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC24A2Q9UI40 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC24A2Q9UI40 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC24A2Q9UI40 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC24A2Q9UI40 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC24A2Q9UI40 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC24A2Q9UI40 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC24A2Q9UI40 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms