Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NKX1-2Q9UD57 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms