Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CHPF2Q9P2E5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms