Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPZ2Q9P299 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPZ2Q9P299 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPZ2Q9P299 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPZ2Q9P299 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPZ2Q9P299 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPZ2Q9P299 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPZ2Q9P299 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPZ2Q9P299 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPZ2Q9P299 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPZ2Q9P299 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPZ2Q9P299 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms