Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SLAIN2Q9P270 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SLAIN2Q9P270 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms