Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SCHIP1Q9P0W5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms