Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHBDL2Q9NX52 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms