Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms