Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC58

SLC24A3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A3Q9HC58 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SLC24A3Q9HC58 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms