Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRCC1Q9C099 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRCC1Q9C099 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRCC1Q9C099 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms