Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NMES1Q9C002 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms