Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NICN1Q9BSH3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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