Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RETNLBQ9BQ08 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RETNLBQ9BQ08 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms