Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMTK3Q96Q04 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMTK3Q96Q04 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms