Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
PRAC1Q96KF2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
PRAC1Q96KF2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms