Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RNFT2Q96EX2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms