Protein–RNA interactions for Protein: Q96C45

ULK4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK4Q96C45 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ULK4Q96C45 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ULK4Q96C45 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ULK4Q96C45 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ULK4Q96C45 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ULK4Q96C45 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ULK4Q96C45 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ULK4Q96C45 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ULK4Q96C45 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ULK4Q96C45 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ULK4Q96C45 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ULK4Q96C45 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ULK4Q96C45 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ULK4Q96C45 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ULK4Q96C45 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ULK4Q96C45 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms