Protein–RNA interactions for Protein: Q96A61

TRIM52, Tripartite motif-containing protein 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM52Q96A61 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM52Q96A61 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms